13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60429 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_60429  predicted protein  100 
 
 
189 aa  388  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0007968  normal  0.2488 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15766  predicted protein  58.16 
 
 
200 aa  234  7e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.841856 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27263  predicted protein  55.21 
 
 
196 aa  227  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03760  conserved hypothetical protein  68.75 
 
 
180 aa  216  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10865  DUF652 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03340)  52.38 
 
 
187 aa  206  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43653  predicted protein  30.99 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0653  nucleotide binding protein PINc  33.06 
 
 
131 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198585  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  32.56 
 
 
136 aa  57  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0587  nucleotide binding protein PINc  29.84 
 
 
131 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.579248  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00160  conserved hypotetical protein  23.77 
 
 
291 aa  48.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92660  predicted protein  23.49 
 
 
243 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0351225  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1331  hypothetical protein  30.65 
 
 
131 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0236  SSU processome protein Utp24  31.45 
 
 
131 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0516612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>