37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59900 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  100 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  58.08 
 
 		 419 aa  308  8e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  38.33 
 
 		 433 aa  216  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  37.29 
 
 		 507 aa  209  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59269  predicted protein  39.07 
 
 		 444 aa  186  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245498  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  30.66 
 
 		 433 aa  141  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  28.89 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  26.28 
 
 		 440 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  32 
 
 		 474 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.745622 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 529 aa  97.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  24.45 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  26.37 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  26.83 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 433 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  26.57 
 
 		 400 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  26.57 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  26.57 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 395 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  21.8 
 
 		 391 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  25.71 
 
 		 414 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 422 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  25 
 
 		 390 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 394 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 394 aa  49.3  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 393 aa  49.3  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 394 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  22.18 
 
 		 389 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  24.84 
 
 		 407 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 388 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  29.28 
 
 		 401 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 395 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  21.69 
 
 		 407 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 404 aa  42.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>