22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58562 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_58562  predicted protein  100 
 
 
279 aa  582  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0813846  normal  0.776229 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01660  conserved hypothetical protein  28.17 
 
 
427 aa  99.8  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.722392  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2419  hypothetical protein  31.12 
 
 
212 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2298  hypothetical protein  30.61 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15952  predicted protein  44.21 
 
 
123 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49419  predicted protein  30.29 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9486  predicted protein  38.64 
 
 
91 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  35.11 
 
 
407 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  28.36 
 
 
730 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  26.14 
 
 
357 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  25.33 
 
 
375 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  27.66 
 
 
513 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  26.73 
 
 
454 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  28.92 
 
 
195 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.85 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  35.85 
 
 
456 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  27.55 
 
 
442 aa  43.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
385 aa  43.5  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  26.85 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  31.03 
 
 
448 aa  42  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
248 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>