More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57984 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57984  glutamyl-tRNA synthetase, mitochondrial  100 
 
 
491 aa  1016    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.604011  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
500 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
502 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
502 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
487 aa  303  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
493 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 
516 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
504 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
504 aa  300  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
503 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
484 aa  298  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
506 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
485 aa  297  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
509 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
502 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
478 aa  294  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
490 aa  293  5e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
485 aa  293  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
489 aa  293  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
484 aa  292  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
490 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
503 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
512 aa  290  6e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
504 aa  289  6e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
506 aa  288  1e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
492 aa  288  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
488 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
484 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
517 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
488 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
486 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.69 
 
 
495 aa  287  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
490 aa  286  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
493 aa  283  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
485 aa  282  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
482 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
494 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
494 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
491 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
503 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
494 aa  280  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
510 aa  279  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
495 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01030  Glutamyl-tRNA synthetase, putative  43.22 
 
 
588 aa  278  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.116915  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
501 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
484 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
488 aa  276  5e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
493 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
494 aa  276  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
514 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
509 aa  274  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
505 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
506 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
493 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
493 aa  273  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
493 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
493 aa  272  9e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
507 aa  272  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
477 aa  272  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
501 aa  272  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 
493 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
464 aa  271  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
500 aa  271  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 
464 aa  270  4e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
488 aa  270  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
491 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
495 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
464 aa  267  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
490 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
502 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
468 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
505 aa  263  8e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
470 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
481 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
470 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  33.72 
 
 
518 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
480 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
466 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
491 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
467 aa  259  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1080  glutamyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
445 aa  259  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
473 aa  257  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 
485 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
485 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
485 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>