40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57574 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_57574  putative transcription initiation factor  100 
 
 		 439 aa  908    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.625866 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02330  metabolism-related protein, putative  38.42 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.633089  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00908  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15740)  27.32 
 
 		 354 aa  90.5  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0205604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3985  Phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 212 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.634777 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0265  Phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0266  Phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0934  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.31 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0772  phosphoglycerate mutase  28.15 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2127  phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 		 215 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00711318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2851  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.796237  normal  0.0465369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 203 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 202 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43298  predicted protein  24.53 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 203 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 203 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 203 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  26.16 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  42.31 
 
 		 242 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3237  phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 		 193 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.879445  normal  0.545559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  24.44 
 
 		 245 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 		 252 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 		 214 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  26.27 
 
 		 216 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1588  Phosphoglycerate mutase  24.32 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  28.99 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.35 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 220 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 206 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 211 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  26.27 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  34.18 
 
 		 308 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  37.74 
 
 		 259 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 223 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 220 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 370 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>