205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57391 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  100 
 
 
306 aa  627  1e-179  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  40.36 
 
 
295 aa  207  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  33.22 
 
 
356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  32.16 
 
 
293 aa  143  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
261 aa  136  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 
258 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  33.97 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
264 aa  126  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  34.73 
 
 
268 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  33.33 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
264 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
252 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
256 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  30.45 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  31.76 
 
 
235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
268 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
258 aa  109  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
264 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  30.04 
 
 
259 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  29.67 
 
 
259 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
259 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  31.18 
 
 
265 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  31.27 
 
 
265 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
254 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  28.9 
 
 
255 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
253 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  29.17 
 
 
261 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
260 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  29.7 
 
 
260 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  31.06 
 
 
262 aa  99.8  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
266 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  30.34 
 
 
258 aa  99  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
266 aa  99  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  28.14 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  28.14 
 
 
255 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  28.81 
 
 
311 aa  97.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
255 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.58 
 
 
264 aa  97.1  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  29.12 
 
 
260 aa  96.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  29.81 
 
 
280 aa  95.9  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
255 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
255 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
252 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
258 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
260 aa  93.2  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  28.68 
 
 
256 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  28.68 
 
 
256 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  28.68 
 
 
256 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  28.68 
 
 
256 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
271 aa  92.4  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
258 aa  92.4  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  28.52 
 
 
255 aa  92.4  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 
265 aa  92.4  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
226 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.4 
 
 
277 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  28.3 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  29.23 
 
 
258 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
258 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
256 aa  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  27.8 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  28.08 
 
 
257 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  28.02 
 
 
255 aa  89.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  27.97 
 
 
254 aa  89  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  27.41 
 
 
254 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  27.38 
 
 
254 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
254 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  27.38 
 
 
254 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  27.38 
 
 
254 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  29.93 
 
 
259 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  27.38 
 
 
254 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  28.2 
 
 
258 aa  86.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
253 aa  85.9  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  27.03 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  24.38 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  29.1 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  27.51 
 
 
230 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  23.26 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
234 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 
282 aa  56.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  21.58 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
239 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
431 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  34.41 
 
 
239 aa  50.1  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 
250 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39469  predicted protein  23.99 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.696258  normal  0.903169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>