17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_55030 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  100 
 
 		 437 aa  911    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  47.33 
 
 		 521 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.344659 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  40.05 
 
 		 398 aa  270  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.251296 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  40.05 
 
 		 398 aa  270  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.180067 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54992  predicted protein  36.92 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030257  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  30.05 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  32.47 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  28.29 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  23.08 
 
 		 390 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  25.46 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  25.64 
 
 		 312 aa  53.9  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  39.18 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  25.2 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  26.32 
 
 		 312 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  25.87 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  32.95 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>