More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52686 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  100 
 
 
117 aa  241  2e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  44.64 
 
 
129 aa  128  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  43 
 
 
105 aa  101  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  47.62 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  45.83 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  44.44 
 
 
105 aa  95.5  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  43.01 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  44.94 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  47.62 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  45.56 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  42.31 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  43.75 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  42.05 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  40.62 
 
 
189 aa  87.4  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  42.7 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  41.24 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  42.7 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  39.36 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  44.05 
 
 
101 aa  84.3  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  37.5 
 
 
330 aa  84.3  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  34.74 
 
 
104 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  43.37 
 
 
104 aa  83.2  1e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  38.3 
 
 
117 aa  83.2  1e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  41.57 
 
 
109 aa  82.8  1e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  37.76 
 
 
146 aa  82.8  1e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  82.8  2e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  43.3 
 
 
114 aa  82  3e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  45.71 
 
 
105 aa  81.3  4e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  39.02 
 
 
123 aa  81.3  4e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  45.45 
 
 
115 aa  81.3  4e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  41.46 
 
 
105 aa  80.9  5e-15  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  38.14 
 
 
108 aa  80.9  5e-15  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  37.11 
 
 
102 aa  80.9  6e-15  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  45.33 
 
 
104 aa  80.9  6e-15  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  37.11 
 
 
147 aa  80.5  8e-15  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  41.25 
 
 
104 aa  80.1  9e-15  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  45.95 
 
 
104 aa  80.1  9e-15  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  40 
 
 
88 aa  79.3  1e-14  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  43.02 
 
 
108 aa  79  2e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  41.49 
 
 
104 aa  79.3  2e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  39.33 
 
 
145 aa  79  2e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  44.12 
 
 
102 aa  79  2e-14  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  35.87 
 
 
124 aa  79  2e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  3.64045e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  38.24 
 
 
103 aa  79  2e-14  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  37.76 
 
 
123 aa  79  2e-14  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  38.2 
 
 
124 aa  78.6  2e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  43.02 
 
 
120 aa  79.3  2e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  42.05 
 
 
105 aa  78.6  3e-14  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  43.24 
 
 
104 aa  78.2  3e-14  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  40 
 
 
105 aa  78.2  3e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  39.02 
 
 
106 aa  78.6  3e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  39.29 
 
 
108 aa  78.2  3e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  46.58 
 
 
108 aa  78.2  3e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  34.82 
 
 
136 aa  78.6  3e-14  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  35.11 
 
 
123 aa  78.2  4e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  35.11 
 
 
123 aa  78.2  4e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  37.63 
 
 
104 aa  78.2  4e-14  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  7.29683e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  36.67 
 
 
144 aa  77.8  5e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  36.67 
 
 
154 aa  77.8  5e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  50 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  38.2 
 
 
109 aa  77.4  7e-14  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  41.77 
 
 
108 aa  77  7e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  36 
 
 
107 aa  77  8e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  36 
 
 
107 aa  77  8e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  36.56 
 
 
124 aa  77  8e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  36 
 
 
107 aa  77  8e-14  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  38.46 
 
 
123 aa  77  8e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  36 
 
 
107 aa  77  8e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  38.04 
 
 
122 aa  77  8e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  33.33 
 
 
144 aa  76.6  9e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  41.67 
 
 
105 aa  76.6  9e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  34.26 
 
 
109 aa  77  9e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  42.11 
 
 
138 aa  76.6  9e-14  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  36.56 
 
 
124 aa  76.6  9e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  38.37 
 
 
109 aa  76.6  9e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.1281e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  38.96 
 
 
109 aa  76.6  1e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  38.46 
 
 
149 aa  76.3  1e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  37.21 
 
 
102 aa  76.6  1e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  42.86 
 
 
149 aa  76.3  1e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  37.89 
 
 
105 aa  76.6  1e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  35.92 
 
 
143 aa  76.3  1e-13  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  43.16 
 
 
110 aa  76.6  1e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  40.26 
 
 
106 aa  76.6  1e-13  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  45.12 
 
 
106 aa  76.6  1e-13  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  40 
 
 
290 aa  76.6  1e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  37.76 
 
 
109 aa  76.3  1e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  39.08 
 
 
104 aa  76.6  1e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.56705e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  37.36 
 
 
144 aa  76.6  1e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  34.31 
 
 
120 aa  75.5  2e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  38.1 
 
 
110 aa  75.5  2e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  40.26 
 
 
109 aa  75.9  2e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  44.05 
 
 
131 aa  75.5  2e-13  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>