39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48947 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  100 
 
 		 725 aa  1501    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  26.71 
 
 		 892 aa  194  7e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  25.58 
 
 		 993 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  24.35 
 
 		 1015 aa  94.7  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  28 
 
 		 235 aa  87.4  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  27.12 
 
 		 1001 aa  79.3  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  24.29 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  25.27 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  25.45 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  23.08 
 
 		 497 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  22.48 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  23.46 
 
 		 498 aa  73.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  30.93 
 
 		 1092 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  24.2 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  31.52 
 
 		 764 aa  68.2  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  22.57 
 
 		 507 aa  68.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  26.09 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  24.62 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  22.74 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  24.83 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  25.17 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  25.09 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  22.43 
 
 		 497 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  22.88 
 
 		 500 aa  63.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  25.47 
 
 		 474 aa  62  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  23.55 
 
 		 483 aa  62  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  24.83 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  25.44 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  24.57 
 
 		 942 aa  60.8  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  22.01 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  35.11 
 
 		 421 aa  57.4  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  24.37 
 
 		 451 aa  54.3  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  34.41 
 
 		 423 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  31.58 
 
 		 422 aa  52.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  34.41 
 
 		 422 aa  51.6  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  35.56 
 
 		 418 aa  51.2  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  23.16 
 
 		 405 aa  47.8  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  24.39 
 
 		 334 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43936  predicted protein  31.58 
 
 		 1223 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>