More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_45980 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_45980  predicted protein  100 
 
 
1180 aa  2403    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00372447  normal  0.0355887 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  41.4 
 
 
932 aa  450  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  48.1 
 
 
810 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  38.11 
 
 
846 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  39.52 
 
 
808 aa  399  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  38.28 
 
 
813 aa  396  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  46.25 
 
 
817 aa  396  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  47.42 
 
 
800 aa  394  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  45.51 
 
 
815 aa  393  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  43.87 
 
 
809 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  42.65 
 
 
804 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  44.24 
 
 
793 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  46.71 
 
 
800 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  45.24 
 
 
797 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  45.32 
 
 
793 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  46.5 
 
 
823 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  42.94 
 
 
768 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  46.83 
 
 
825 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  46.3 
 
 
817 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  45.76 
 
 
819 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  47.96 
 
 
775 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  44.65 
 
 
811 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  46.28 
 
 
817 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  46.06 
 
 
812 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  46.38 
 
 
819 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  45.57 
 
 
898 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  46.06 
 
 
812 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  45.92 
 
 
815 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  44.61 
 
 
806 aa  376  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  43.87 
 
 
815 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  45.65 
 
 
816 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  44.88 
 
 
801 aa  376  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  44.68 
 
 
820 aa  376  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0427  ATP-dependent protease La  44.05 
 
 
820 aa  375  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.272294  normal  0.22143 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  45.93 
 
 
806 aa  376  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  45.48 
 
 
806 aa  376  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  44.21 
 
 
812 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  45.89 
 
 
835 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  45.62 
 
 
774 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  44.66 
 
 
880 aa  372  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 
788 aa  373  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  47.22 
 
 
792 aa  373  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  46.53 
 
 
775 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  43.95 
 
 
797 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  47.4 
 
 
821 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  44.06 
 
 
776 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  46.49 
 
 
786 aa  370  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  43.85 
 
 
773 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  45.28 
 
 
817 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.85 
 
 
776 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.85 
 
 
776 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  43.85 
 
 
776 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  46.71 
 
 
820 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  45.15 
 
 
813 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  46.02 
 
 
804 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  43.08 
 
 
803 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  42.74 
 
 
836 aa  369  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  45.07 
 
 
810 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  45.05 
 
 
809 aa  369  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  43.89 
 
 
856 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  42.2 
 
 
776 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  43.85 
 
 
773 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  43.65 
 
 
776 aa  366  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  43.92 
 
 
773 aa  366  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  44.74 
 
 
807 aa  366  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  45.63 
 
 
809 aa  366  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.12 
 
 
773 aa  366  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  43.64 
 
 
807 aa  365  2e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  44.54 
 
 
786 aa  366  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  43.7 
 
 
828 aa  365  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  44.21 
 
 
802 aa  365  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  43.59 
 
 
824 aa  365  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  43.56 
 
 
843 aa  365  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  44.21 
 
 
812 aa  364  5.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  42 
 
 
776 aa  364  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  45.15 
 
 
805 aa  363  7.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  44.54 
 
 
783 aa  363  9e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  44.26 
 
 
779 aa  363  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  43.66 
 
 
835 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  46.71 
 
 
797 aa  362  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  44.84 
 
 
814 aa  363  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  43.52 
 
 
816 aa  362  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  43.44 
 
 
835 aa  362  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  43.87 
 
 
788 aa  361  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  45.01 
 
 
781 aa  361  4e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  44.64 
 
 
798 aa  361  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  43.87 
 
 
788 aa  361  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  45.68 
 
 
815 aa  360  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  43.95 
 
 
823 aa  360  6e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  38.58 
 
 
835 aa  360  8e-98  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  45.12 
 
 
825 aa  360  8e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  43.35 
 
 
802 aa  360  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  44.33 
 
 
811 aa  360  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  43.35 
 
 
802 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  44.63 
 
 
810 aa  358  5e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  44.73 
 
 
808 aa  357  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  44.68 
 
 
815 aa  358  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  44.23 
 
 
789 aa  357  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2218  Lon-A peptidase  45.11 
 
 
819 aa  357  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  42.71 
 
 
798 aa  357  8.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>