More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_45334 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_45334  zinc- and cadmium resistance protein  100 
 
 
419 aa  857    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00316913  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01795  CDF divalent metal cation transporter (Eurofung)  39.17 
 
 
500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04240  di-, tri-valent inorganic cation transporter, putative  58.91 
 
 
523 aa  155  9e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0193268  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  26.93 
 
 
398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10876  CDF divalent metal cation transporter (Eurofung)  33.51 
 
 
351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.132925  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23557  predicted protein  26.88 
 
 
395 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0012491  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  26.27 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  38.18 
 
 
317 aa  92  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  38.4 
 
 
312 aa  90.1  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  38.02 
 
 
336 aa  89.7  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  39.82 
 
 
309 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  33.83 
 
 
325 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  39.2 
 
 
300 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  33.83 
 
 
325 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  32.81 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  34.13 
 
 
315 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  39.17 
 
 
298 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  39.17 
 
 
298 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  39.17 
 
 
298 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  34.65 
 
 
300 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  35.77 
 
 
307 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  38.76 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  36.64 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  33.33 
 
 
306 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  39.17 
 
 
332 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 
324 aa  84  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  39.37 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  39.84 
 
 
312 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  39.84 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  39.84 
 
 
312 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  39.02 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  31.75 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  38.84 
 
 
326 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  38.06 
 
 
298 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  39.83 
 
 
342 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 
297 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  34.19 
 
 
327 aa  82  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  31.86 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  39.84 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0231  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  39.84 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  40.71 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1433  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  37.19 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  39.02 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  32.73 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  37.01 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  41.82 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  31.86 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.37 
 
 
304 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  32.79 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  32.06 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  35.83 
 
 
299 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  30.97 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.97 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  30.97 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  35.9 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  30.47 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  36.64 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  31.78 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  30.97 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  38.14 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  36.13 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  36.13 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.86 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  33.85 
 
 
335 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 
313 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  40.65 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  42 
 
 
306 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  40.65 
 
 
325 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  39.83 
 
 
320 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  38.14 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  35 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  34.13 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  39.83 
 
 
300 aa  75.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  28.8 
 
 
356 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  35.83 
 
 
314 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  34.62 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  33.61 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  39.83 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>