More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43795 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  100 
 
 
816 aa  1649    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  43.99 
 
 
883 aa  435  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  42.89 
 
 
951 aa  405  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  37.1 
 
 
715 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  36.86 
 
 
715 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 
756 aa  276  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  36.45 
 
 
747 aa  268  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 
723 aa  257  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  34.39 
 
 
764 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  35.92 
 
 
775 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  36.34 
 
 
715 aa  249  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  37.4 
 
 
703 aa  234  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 
420 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  29.87 
 
 
767 aa  232  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 
482 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 
689 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  34.76 
 
 
416 aa  213  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 
495 aa  210  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 
429 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 
419 aa  206  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  36.78 
 
 
683 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 
425 aa  204  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  30.2 
 
 
421 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  34.24 
 
 
427 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 
455 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  32.81 
 
 
460 aa  190  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 
423 aa  184  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 
422 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 
748 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 
749 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  31.7 
 
 
750 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  34.64 
 
 
439 aa  174  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  30.63 
 
 
448 aa  173  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 
448 aa  173  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  29.83 
 
 
410 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.22 
 
 
430 aa  171  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.67 
 
 
410 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 
414 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.73 
 
 
410 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 
410 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 
414 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 
416 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 
406 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 
406 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  29.81 
 
 
452 aa  153  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.13 
 
 
442 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 
436 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 
460 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  27.62 
 
 
446 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 
435 aa  142  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 
413 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 
573 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.93 
 
 
625 aa  138  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  29.19 
 
 
425 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  30.93 
 
 
592 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.93 
 
 
547 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.93 
 
 
547 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 
445 aa  132  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 
410 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.25 
 
 
410 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.25 
 
 
410 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.43 
 
 
444 aa  125  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 
444 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.43 
 
 
444 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 
444 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 
444 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25.91 
 
 
389 aa  119  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.46 
 
 
387 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.46 
 
 
387 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 
435 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  24.63 
 
 
414 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.7 
 
 
387 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.46 
 
 
387 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.7 
 
 
387 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.7 
 
 
387 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.57 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.46 
 
 
387 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.7 
 
 
387 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.64 
 
 
387 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.65 
 
 
399 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  23.73 
 
 
385 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 
386 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  24.75 
 
 
424 aa  109  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.47 
 
 
427 aa  105  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  23.46 
 
 
375 aa  105  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  24.21 
 
 
375 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 
385 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  24.88 
 
 
424 aa  103  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  24.43 
 
 
712 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  23.9 
 
 
396 aa  102  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  22.72 
 
 
375 aa  101  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  22.72 
 
 
375 aa  101  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  22.72 
 
 
375 aa  101  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  22.72 
 
 
375 aa  101  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  22.72 
 
 
375 aa  101  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  22.72 
 
 
375 aa  101  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  25.4 
 
 
767 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 
404 aa  100  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.5 
 
 
386 aa  99.8  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>