159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43263 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  989    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  38.79 
 
 
464 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  38.12 
 
 
464 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.69 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  27.66 
 
 
453 aa  150  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  26.17 
 
 
470 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  26.86 
 
 
446 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 
501 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  25.58 
 
 
470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  26.73 
 
 
450 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  25.69 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  23.95 
 
 
456 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  26.62 
 
 
481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  25.05 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  25.71 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  27.23 
 
 
456 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  27.27 
 
 
469 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  27.61 
 
 
460 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  27.89 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  26.68 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  26.8 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  26.55 
 
 
481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  26.36 
 
 
458 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  25.89 
 
 
488 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  26.86 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  26.38 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  26.88 
 
 
483 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  24.18 
 
 
455 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  27.52 
 
 
462 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  24.89 
 
 
482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  24.56 
 
 
450 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  26.43 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  25.23 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  27.19 
 
 
463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  27.19 
 
 
464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  25.67 
 
 
457 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07940  conserved hypothetical protein  47.83 
 
 
374 aa  113  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  25.31 
 
 
504 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  27.02 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  25.38 
 
 
451 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  27.94 
 
 
494 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  23.83 
 
 
453 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  24.26 
 
 
481 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  26.15 
 
 
449 aa  108  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  24.89 
 
 
453 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  25.21 
 
 
460 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  29.33 
 
 
442 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  26.73 
 
 
463 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  25.66 
 
 
461 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  25.6 
 
 
455 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  23.75 
 
 
463 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  24.89 
 
 
500 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  24.13 
 
 
462 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  24.51 
 
 
454 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  26.7 
 
 
443 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  26.65 
 
 
439 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  23.59 
 
 
461 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  25.71 
 
 
461 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  24.34 
 
 
489 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  27.49 
 
 
453 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  27.65 
 
 
465 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  27.88 
 
 
447 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  24.89 
 
 
457 aa  99.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  24.08 
 
 
449 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  26.05 
 
 
459 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  24.63 
 
 
472 aa  98.6  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  24.12 
 
 
441 aa  99  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  25.57 
 
 
456 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  22.74 
 
 
468 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  29.15 
 
 
458 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  24.6 
 
 
471 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  23.35 
 
 
469 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  23.42 
 
 
461 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  25.92 
 
 
457 aa  97.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  23.81 
 
 
476 aa  96.7  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  24.03 
 
 
476 aa  96.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  25.62 
 
 
458 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  24.66 
 
 
503 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 
462 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  24.2 
 
 
467 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  27.19 
 
 
453 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  24.41 
 
 
457 aa  94  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  22.3 
 
 
441 aa  94  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  25.89 
 
 
458 aa  93.2  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  25.12 
 
 
454 aa  93.6  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  23.43 
 
 
453 aa  93.2  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  22.82 
 
 
504 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  21.77 
 
 
487 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  24.66 
 
 
468 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  23.33 
 
 
474 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  25.85 
 
 
453 aa  91.7  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  24.17 
 
 
451 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  23.03 
 
 
490 aa  90.5  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  23.31 
 
 
456 aa  90.5  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  21.94 
 
 
491 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  24.89 
 
 
503 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  21.94 
 
 
491 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  23.77 
 
 
472 aa  90.1  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  21.94 
 
 
491 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  24.89 
 
 
503 aa  90.1  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>