116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_41720 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  70.75 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  58.46 
 
 		 213 aa  235  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  50.76 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  49.28 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  37.11 
 
 		 246 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  31.75 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  29.69 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  29.95 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  28.87 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  30.65 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  30.65 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  29.67 
 
 		 267 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  28.65 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  30.3 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.26 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  28.57 
 
 		 301 aa  85.5  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  29.35 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  31.18 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  28.98 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  30.15 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  29.1 
 
 		 297 aa  81.6  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  27.23 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  29.15 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  29.38 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.74 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  26.88 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  26.7 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  28.28 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  27.81 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  27.23 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.18 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  26.88 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  27.08 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  27.75 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  26.77 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  29.26 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  25.53 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  28.14 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  27.84 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  24.61 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  25.24 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  31.92 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  24.61 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  24.87 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.14 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  23.35 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  28.64 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  28.08 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.27 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  25.13 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  28.02 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  25.45 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  27.86 
 
 		 292 aa  64.7  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  28.22 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  27.46 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  26.67 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  25.65 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  25.97 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  28.37 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.63 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  28.57 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  24.23 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  26.02 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  27.57 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  22.87 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  25.93 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  28.8 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  24.27 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  25.27 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  26.42 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  25.91 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  25.4 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  28.49 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  27.17 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  25.41 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  26.18 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  23.2 
 
 		 280 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  21.76 
 
 		 289 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  27.04 
 
 		 303 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  22.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  26.27 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  26.27 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  26.27 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  27.32 
 
 		 324 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  23.4 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  22.87 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  25.58 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  25.3 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  24.21 
 
 		 280 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  24.55 
 
 		 272 aa  48.1  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  29.06 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  22.42 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  25.12 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  21.99 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  25.57 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  23.68 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  25.12 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  26.02 
 
 		 306 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>