169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40120 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  100 
 
 		 304 aa  628  1e-179  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  41.06 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  32.73 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  30.38 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  31.72 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  35.8 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  31.72 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  30.43 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  33.94 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  32.31 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  31.48 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  31.02 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  31.02 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  31.02 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  31.02 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  31.02 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  29.5 
 
 		 271 aa  92.4  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  31.02 
 
 		 284 aa  92.4  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  31.02 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  27.62 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  30.56 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  32.24 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  29.85 
 
 		 282 aa  89.4  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  28.74 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  29.18 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  27.35 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  31.72 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  32.99 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  28.11 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  31.28 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  27.73 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  26.62 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  26.94 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  27.64 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  30.96 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  26.94 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  26.94 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  24.6 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  26.4 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  24.55 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  28.24 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28215  predicted protein  27.03 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  33.67 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.45 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  26.86 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  28.46 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  26.12 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  27.78 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  26.17 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  25.7 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  26.79 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  25.13 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  32.24 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  26.49 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  24.57 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  27.19 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  25.71 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  27.47 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  24.19 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.36 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  26.94 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  26.27 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  26.85 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_6846  predicted protein  27.12 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.86 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.29 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  26.24 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  24.62 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  25.79 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.33 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  26.64 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  28.83 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  26.04 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21275  predicted protein  25.71 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  27.74 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  27.91 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  31.85 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  25.62 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3153  hypothetical protein  24.68 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  25.76 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1059  RTX protein  25.45 
 
 		 2648 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2105  hypothetical protein  24.57 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290661  normal  0.634912 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11180  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01760)  24.5 
 
 		 559 aa  56.2  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0975397  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2084  alpha/beta fold family hydrolase N  24.16 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  24.26 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  32.74 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  28 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  23.51 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3465  hypothetical protein  31.03 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  27.54 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  29.8 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  25.6 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  32.69 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1334  hydrolase with alpha/beta fold  22.86 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.706412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>