280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39588 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  100 
 
 		 556 aa  1146    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  44.53 
 
 		 503 aa  302  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  33.05 
 
 		 422 aa  176  7e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  25.64 
 
 		 570 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  31.75 
 
 		 261 aa  101  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  41.06 
 
 		 386 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  27.6 
 
 		 253 aa  87.8  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  34.72 
 
 		 358 aa  87.8  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  35.62 
 
 		 396 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  24.43 
 
 		 669 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  36.11 
 
 		 569 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  36.81 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  32.04 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  32.64 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.1 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  37.42 
 
 		 236 aa  82.4  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  36.67 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  30.22 
 
 		 141 aa  77.8  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  25.97 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  26.98 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  26.98 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  31.97 
 
 		 342 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  33.78 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  31.97 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  34.9 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  28.08 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.38 
 
 		 267 aa  72.8  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 298 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  36.18 
 
 		 225 aa  72.8  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  33.33 
 
 		 554 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  32.24 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  34.21 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  26.01 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  29.94 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  29.93 
 
 		 289 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  31.76 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  29.93 
 
 		 289 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  34.97 
 
 		 224 aa  69.3  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  37.36 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  29.93 
 
 		 289 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  31.54 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  31.76 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  23.02 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  31.85 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  33.58 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  31.03 
 
 		 190 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  29.85 
 
 		 360 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  34.64 
 
 		 235 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  32.64 
 
 		 219 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  29.85 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  30.77 
 
 		 365 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  34.64 
 
 		 235 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  33.08 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  29.32 
 
 		 228 aa  65.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  29.66 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  31.08 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  29.03 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  28.38 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  33.13 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  32.9 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  33 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  29.63 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  31.48 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  31.48 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  29.37 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  31.48 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  29.57 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  30.2 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  31.48 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  26.17 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  31.48 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  42.55 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  31.21 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  31.68 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  30.97 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  29.77 
 
 		 625 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  29.77 
 
 		 625 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  27.85 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.77 
 
 		 625 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  32.26 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  31.62 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  31.87 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  34.01 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  31.01 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  31.03 
 
 		 267 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  28.75 
 
 		 260 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  42.27 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  28.24 
 
 		 625 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  35.92 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2170  rhomboid family protein  33.09 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000411867 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  26.9 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  30.88 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  35.11 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>