More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39517 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_39517  xylose transporter, high affinity, putative similarity to STL13  100 
 
 
417 aa  860    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000189877  normal  0.584414 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05104  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07700)  51.21 
 
 
576 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0144049  hitchhiker  0.00149978 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_16856  high affinity xylose transporter (putative) (HGT3)  49.48 
 
 
529 aa  381  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0752816  normal  0.401981 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03220  receptor, putative  47.58 
 
 
561 aa  354  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  36.7 
 
 
566 aa  243  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02665  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02010)  35.42 
 
 
541 aa  239  8e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  33.56 
 
 
561 aa  237  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08340  hexose transport-related protein, putative  32.96 
 
 
550 aa  219  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00250  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14442)  32.08 
 
 
547 aa  209  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39560  sugar transporter, putative  32.84 
 
 
551 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0538769 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33971  Sugar transporter, putative (STL12)  34.14 
 
 
544 aa  206  8e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02420  receptor, putative  32.1 
 
 
550 aa  200  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.915792  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57820  sugar transporter  31.33 
 
 
529 aa  201  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00705004  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  30.91 
 
 
561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  31.47 
 
 
590 aa  196  6e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03400  hexose transport-related protein, putative  30.32 
 
 
535 aa  195  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  30.95 
 
 
550 aa  193  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09168  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  29.06 
 
 
543 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.050203  normal  0.0522811 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  30.54 
 
 
579 aa  188  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08467  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11050)  30.71 
 
 
532 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  0.181108 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04630  conserved hypothetical protein  30.58 
 
 
499 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02585  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05190)  30.12 
 
 
499 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.253437 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08972  conserved hypothetical protein  29.45 
 
 
743 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00490  sugar transporter, putative  29.87 
 
 
592 aa  179  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.75075  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03580  hexose transport-related protein, putative  31.01 
 
 
595 aa  179  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01940  monosaccharide transporter, putative  30.71 
 
 
599 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04310  monosaccharide transporter, putative  30.75 
 
 
591 aa  176  7e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02958  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06720)  28.08 
 
 
520 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.280694 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03233  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14670)  32.23 
 
 
517 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04148  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13080)  28.57 
 
 
548 aa  172  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.900838  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09169  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  27.43 
 
 
510 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0950433  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02475  Putative sugar transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870E7]  29.9 
 
 
490 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07667  conserved hypothetical protein  29.78 
 
 
512 aa  170  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.341465 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40173  Sugar transporter  29.68 
 
 
468 aa  168  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08084  conserved hypothetical protein  32.27 
 
 
430 aa  166  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01276  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09910)  29.06 
 
 
504 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.438181 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02544  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 
552 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01138  Quinate permease (Quinate transporter) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P15325]  29.57 
 
 
533 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06923  High-affinity hexose transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874U9]  28.64 
 
 
531 aa  159  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00070  monosaccharide transporter, putative  29.69 
 
 
590 aa  159  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00260  sugar transporter, putative  28.5 
 
 
542 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00120  sugar transporter, putative  27.62 
 
 
539 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.891292  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  28.38 
 
 
529 aa  157  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00020  glucose transporter, putative  29.04 
 
 
519 aa  156  6e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  27.49 
 
 
534 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02466  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14170)  27.58 
 
 
536 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10891  Putative hexose transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2WBH1]  28.32 
 
 
535 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.148796  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02100  monosaccharide transporter, putative  27.12 
 
 
510 aa  153  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55800  High-affinity Glucose Transporter (putative)  31.01 
 
 
542 aa  153  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05200  hexose transport-related protein, putative  24.71 
 
 
535 aa  153  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  29.22 
 
 
468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02730  sugar transporter, putative  29.12 
 
 
545 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05050  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12170)  30.41 
 
 
495 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00148453  hitchhiker  0.00000000414532 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05860  Putative low affinity glucose transporter MstE [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q400D8]  28.57 
 
 
562 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0426596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  31.93 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  31.28 
 
 
476 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  31.93 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  31.93 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  31.93 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  31.93 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  31.93 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.6 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09184  conserved hypothetical protein  28.61 
 
 
531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  28.3 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08737  MSTA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J220]  28.08 
 
 
527 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.187861  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  30.93 
 
 
491 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  29.6 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02680  glucose transporter, putative  29.05 
 
 
552 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  30.3 
 
 
448 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01480  hexose transport-related protein, putative  29.9 
 
 
520 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05029  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 
536 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.800543  normal  0.720485 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  28.42 
 
 
477 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  28.14 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04277  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  28.39 
 
 
584 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.851042  normal  0.103558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  30.98 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  29.92 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  29.1 
 
 
464 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  29.1 
 
 
464 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  29.1 
 
 
464 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  29.1 
 
 
464 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  29.1 
 
 
464 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06098  conserved hypothetical protein  30.27 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00927038 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  27.27 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  29.03 
 
 
446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01797  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  28.42 
 
 
512 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000141005  normal  0.63949 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06848  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12950)  27.46 
 
 
563 aa  139  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.817086  normal  0.150124 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85501  High-affinity glucose transporter  29.06 
 
 
747 aa  139  8.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0464607  normal  0.964846 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91253  glucose transporter/sensor  28.57 
 
 
528 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06805  conserved hypothetical protein  26.93 
 
 
549 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  28.76 
 
 
491 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36948  high-affinity hexose (glucose) transporter  27.75 
 
 
525 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.046165  normal  0.598705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  28.88 
 
 
466 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77210  quinate permease  26.12 
 
 
594 aa  137  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.436623  normal  0.677517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  28.84 
 
 
464 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  28.12 
 
 
465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  29.03 
 
 
480 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  27.51 
 
 
470 aa  135  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  28.57 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  27.72 
 
 
507 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  28.57 
 
 
464 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>