More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39465 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03832  translation elongation factor G1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08110)  63.76 
 
 
799 aa  959  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1660  elongation factor G  50.36 
 
 
695 aa  708  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.264114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1934  elongation factor G  53.01 
 
 
693 aa  743  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2292  elongation factor G  50.43 
 
 
694 aa  708  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32800  predicted protein  56 
 
 
700 aa  793  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2784  elongation factor G  51.95 
 
 
696 aa  723  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621972  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0550  elongation factor G  52.11 
 
 
693 aa  726  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.276809  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39465  predicted protein  100 
 
 
745 aa  1539  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  unclonable  2.68657e-07 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0548  translation elongation factor G  53.43 
 
 
695 aa  744  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1583  elongation factor G  50.22 
 
 
694 aa  706  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.93602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2813  elongation factor G  51.37 
 
 
695 aa  718  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115924  normal  0.668258 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2166  translation elongation factor G  46.84 
 
 
710 aa  657  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1049  elongation factor G  55.65 
 
 
695 aa  780  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00560945  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01520  elongation factor g 1, mitochondrial precursor (mef-g-1), putative  57.01 
 
 
811 aa  863  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.671168  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  45.91 
 
 
700 aa  600  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  45.88 
 
 
698 aa  589  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  45.24 
 
 
706 aa  589  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  44.83 
 
 
698 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  45.6 
 
 
698 aa  588  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  44.68 
 
 
703 aa  583  1e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  45.05 
 
 
698 aa  584  1e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1778  translation elongation factor G  43.88 
 
 
682 aa  584  1e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  44.27 
 
 
692 aa  579  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  44.27 
 
 
692 aa  577  1e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  44.6 
 
 
700 aa  575  1e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  45.32 
 
 
691 aa  576  1e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  45.14 
 
 
691 aa  577  1e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  44.67 
 
 
691 aa  577  1e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  9.20124e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  44.03 
 
 
691 aa  573  1e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  44.24 
 
 
702 aa  574  1e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  45.27 
 
 
692 aa  572  1e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  3.92838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  45.27 
 
 
692 aa  572  1e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  6.47757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  44.35 
 
 
689 aa  575  1e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  44.32 
 
 
691 aa  572  1e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  44.96 
 
 
692 aa  572  1e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  43.92 
 
 
697 aa  575  1e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  45.27 
 
 
692 aa  572  1e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.10071e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  43.7 
 
 
691 aa  572  1e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  2.19808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  44.83 
 
 
692 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.09677e-07  unclonable  1.50309e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  45.12 
 
 
692 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.43993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  44.75 
 
 
691 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  44.75 
 
 
691 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  44.98 
 
 
692 aa  571  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  43.22 
 
 
699 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  44.98 
 
 
692 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.90247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  43.94 
 
 
708 aa  572  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  44.69 
 
 
692 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  43.33 
 
 
693 aa  570  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  45.27 
 
 
692 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  44.2 
 
 
692 aa  569  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.42734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  43.7 
 
 
692 aa  572  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  5.56702e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  43.78 
 
 
705 aa  569  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  44.57 
 
 
691 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  44.75 
 
 
691 aa  571  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  43.86 
 
 
704 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  43.66 
 
 
695 aa  569  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  3.03107e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  44.52 
 
 
694 aa  571  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  44.52 
 
 
694 aa  571  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  45.17 
 
 
691 aa  572  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  2.60019e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  44.57 
 
 
691 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  44.57 
 
 
704 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.85563e-08  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  45.12 
 
 
692 aa  572  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  43.27 
 
 
692 aa  570  1e-161  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.15728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  45.92 
 
 
703 aa  566  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  42.45 
 
 
709 aa  567  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.11702e-07  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  43.62 
 
 
703 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  44.03 
 
 
691 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  43.79 
 
 
708 aa  568  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  3.65208e-08  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  44.03 
 
 
692 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.23332e-20 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  43.12 
 
 
691 aa  562  1e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.61111e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  43.21 
 
 
691 aa  562  1e-159  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  43.49 
 
 
691 aa  562  1e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  43.81 
 
 
692 aa  564  1e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.24117e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  43.74 
 
 
691 aa  562  1e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0584  elongation factor G  42.74 
 
 
696 aa  563  1e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000111749  hitchhiker  0.000972187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  43.1 
 
 
700 aa  564  1e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  43.86 
 
 
701 aa  564  1e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  44.25 
 
 
692 aa  562  1e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0400  elongation factor G  44.79 
 
 
704 aa  565  1e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000255179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  44.23 
 
 
697 aa  563  1e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  2.18328e-05  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0753  elongation factor G  44.99 
 
 
713 aa  563  1e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.026843  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  43.16 
 
 
689 aa  560  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.11404e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  43.5 
 
 
692 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  43.67 
 
 
697 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  44.73 
 
 
692 aa  561  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  43.42 
 
 
691 aa  561  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  44.57 
 
 
689 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  4.50896e-07  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  43.61 
 
 
699 aa  561  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  44.27 
 
 
698 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  43.83 
 
 
699 aa  561  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  43.06 
 
 
699 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  42.9 
 
 
698 aa  559  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.31076e-27 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  43.83 
 
 
699 aa  560  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  42.88 
 
 
694 aa  561  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  44.14 
 
 
692 aa  561  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  43.92 
 
 
704 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.25417e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  43.92 
 
 
704 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.52954e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  44.6 
 
 
701 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  4.45234e-07 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  44.27 
 
 
697 aa  556  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  43.52 
 
 
700 aa  558  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>