95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_38885 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  57.02 
 
 		 261 aa  275  6e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  58.82 
 
 		 272 aa  263  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  46.49 
 
 		 215 aa  216  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  40.09 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  28.1 
 
 		 204 aa  92.8  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14449  predicted protein  29.6 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0963899  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  29.95 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  29.13 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  29.33 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  27.36 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  27.18 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  26.96 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  25.94 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  28.43 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  27.59 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  26.09 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.74 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  26.13 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  26.83 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  26.83 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  25.62 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  27.59 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  27.05 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.09 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  26.21 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  24.51 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  25.36 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  24.14 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  26.21 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  26.13 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  26.11 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  25.12 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  23.27 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  26.54 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  25.45 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  24.52 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  25.94 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  26.32 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  25.62 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  25.36 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  23.68 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  22.8 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  28.35 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  28.35 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  30.52 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  21.7 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  27.42 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  25 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  29.87 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  28.74 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  25 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  22.22 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  24.3 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  29.11 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  24.76 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  28.47 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  28.04 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12731  predicted protein  25.76 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  21.94 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  26.09 
 
 		 250 aa  48.5  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  26.85 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  24.88 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  25 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  24.87 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  26.77 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  29.17 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  27.71 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  28.26 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  25 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  25.17 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  25 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  30.71 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  26.03 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  28.06 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  23.78 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  22.75 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  23.3 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.98 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  23.08 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  25.95 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  23.72 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.21 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  26.8 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  22.77 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  24.84 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10708  hypothetical proteasome beta 7 subunit (Eurofung)  21.97 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  23.16 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  23.12 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  22.34 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  22.45 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  25.33 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  22.79 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  20.18 
 
 		 289 aa  42  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>