More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36809 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  60.44 
 
 
1073 aa  1298    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  43.32 
 
 
1023 aa  807    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  50 
 
 
998 aa  969    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  60.08 
 
 
1068 aa  1212    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  49.52 
 
 
933 aa  934    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  100 
 
 
1068 aa  2206    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  37.86 
 
 
872 aa  578  1.0000000000000001e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  34.85 
 
 
1175 aa  555  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  40.75 
 
 
1239 aa  441  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  42.12 
 
 
1185 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  28.78 
 
 
893 aa  355  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  28.56 
 
 
904 aa  345  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  29.13 
 
 
906 aa  344  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  28.89 
 
 
936 aa  341  4e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  34.52 
 
 
1293 aa  332  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.51 
 
 
947 aa  330  8e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  28.18 
 
 
918 aa  330  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.36 
 
 
952 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  35.27 
 
 
889 aa  322  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  26.96 
 
 
909 aa  321  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  37.67 
 
 
919 aa  317  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  38.69 
 
 
927 aa  316  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  38.03 
 
 
924 aa  316  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.48 
 
 
927 aa  316  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  27.66 
 
 
905 aa  315  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.6 
 
 
996 aa  314  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.5 
 
 
951 aa  312  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  26.78 
 
 
953 aa  310  6.999999999999999e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.23 
 
 
933 aa  310  8e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  37 
 
 
926 aa  309  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  36.78 
 
 
952 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.32 
 
 
981 aa  307  8.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  37.22 
 
 
924 aa  304  7.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  28.81 
 
 
908 aa  304  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  28.38 
 
 
908 aa  303  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  35.13 
 
 
972 aa  303  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.03 
 
 
917 aa  303  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  36.55 
 
 
924 aa  303  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  39.16 
 
 
890 aa  302  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  34.7 
 
 
908 aa  303  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  26.87 
 
 
1003 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  35.96 
 
 
908 aa  298  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  35.42 
 
 
940 aa  296  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  37.18 
 
 
916 aa  295  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.84 
 
 
918 aa  295  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.84 
 
 
918 aa  295  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.84 
 
 
918 aa  295  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  27.93 
 
 
1055 aa  294  7e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.75 
 
 
964 aa  293  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.4 
 
 
929 aa  294  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.8 
 
 
950 aa  293  9e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.6 
 
 
919 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.63 
 
 
815 aa  293  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  34.22 
 
 
994 aa  291  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  32.68 
 
 
877 aa  291  5.0000000000000004e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  34.09 
 
 
906 aa  289  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.4 
 
 
984 aa  284  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.58 
 
 
921 aa  283  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.1 
 
 
762 aa  282  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  30.58 
 
 
967 aa  274  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  30.39 
 
 
967 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.06 
 
 
932 aa  268  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.08 
 
 
709 aa  231  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.3 
 
 
843 aa  227  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.56 
 
 
817 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.55 
 
 
990 aa  195  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  51.55 
 
 
1026 aa  191  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.77 
 
 
950 aa  183  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  47.29 
 
 
961 aa  181  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.47 
 
 
931 aa  179  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.5 
 
 
845 aa  178  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.04 
 
 
424 aa  171  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  46.39 
 
 
863 aa  170  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.47 
 
 
868 aa  168  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.19 
 
 
827 aa  164  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.03 
 
 
835 aa  160  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  27.87 
 
 
885 aa  160  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  35.14 
 
 
935 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.14 
 
 
922 aa  149  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.02 
 
 
709 aa  147  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.8 
 
 
951 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  26.94 
 
 
830 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.19 
 
 
715 aa  142  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  29.31 
 
 
760 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.62 
 
 
700 aa  140  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  41.15 
 
 
1209 aa  139  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  27.51 
 
 
861 aa  135  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.38 
 
 
950 aa  135  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  26.99 
 
 
693 aa  132  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.44 
 
 
870 aa  131  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.4 
 
 
791 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  27.76 
 
 
729 aa  128  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2083  DSH domain protein  33.33 
 
 
516 aa  128  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00750043  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.24 
 
 
707 aa  127  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.23 
 
 
707 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.83 
 
 
739 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  24.9 
 
 
723 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  26.7 
 
 
824 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.33 
 
 
800 aa  122  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.84 
 
 
707 aa  122  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>