More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34802 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_34802  putative permease  100 
 
 
553 aa  1144    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0082411 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_33997  allantoate permease  78.2 
 
 
539 aa  915    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46242  putative allantoate permease  47.3 
 
 
543 aa  543  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.33164  normal  0.606185 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65827  putative allantoate permease  47.5 
 
 
544 aa  536  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.429741 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04106  conserved hypothetical protein  48.94 
 
 
562 aa  508  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789789  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03066  conserved hypothetical protein  43.82 
 
 
537 aa  475  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04107  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00120)  47.29 
 
 
575 aa  460  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33930  allantoate permease  40.84 
 
 
577 aa  440  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398969  normal  0.94031 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06810  transporter, putative  44.6 
 
 
566 aa  426  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02959  transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07950)  41.99 
 
 
565 aa  416  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374716 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00850  transporter, putative  43.06 
 
 
538 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.652064  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04129  hypothetical protein  40.24 
 
 
599 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451273  normal  0.0581011 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08595  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17160)  39.44 
 
 
523 aa  359  6e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02196  conserved hypothetical protein  39.74 
 
 
555 aa  358  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07280  transporter, putative  28.73 
 
 
524 aa  195  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03450  tartrate transporter, putative  29.61 
 
 
503 aa  188  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.562433  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06590  hypothetical protein  28.06 
 
 
494 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219204  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08342  conserved hypothetical protein  27.73 
 
 
456 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0576295  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06680  conserved hypothetical protein  25.7 
 
 
515 aa  160  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00030  hypothetical protein  26.26 
 
 
505 aa  159  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02880  High-affinity nicotinic acid transporter, putative  27.35 
 
 
508 aa  155  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08578  conserved hypothetical protein  35.52 
 
 
243 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000715764  hitchhiker  0.00000000000000344826 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00993  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11320)  25 
 
 
496 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02344  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00710)  24.6 
 
 
493 aa  150  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09392  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04010)  24.67 
 
 
568 aa  146  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05650  conserved hypothetical protein  21.99 
 
 
489 aa  140  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0116701  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57264  Transporter of Nicotinic Acid  25.89 
 
 
508 aa  140  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09010  MFS nicotinic acid transporter Tna1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03820)  24.36 
 
 
503 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11116  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02730)  24.68 
 
 
489 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01110  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11820)  23.66 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  0.983602 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10487  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08340)  23.62 
 
 
524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.735037 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00260  hypothetical protein  23.57 
 
 
540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00951238  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04690  transporter, putative  24.06 
 
 
523 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10075  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01812)  22.61 
 
 
541 aa  130  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0433622 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02831  conserved hypothetical protein  25.21 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983705  normal  0.0394534 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01460  allantoate transporter, putative  24.58 
 
 
548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.44811  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02030  conserved hypothetical protein  23.77 
 
 
527 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11189  conserved hypothetical protein  25.36 
 
 
495 aa  127  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0397486  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02282  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06290)  26.34 
 
 
503 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02660  hypothetical protein  23.72 
 
 
532 aa  123  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.11556  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00570  hypothetical protein  22.75 
 
 
487 aa  123  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09336  conserved hypothetical protein  21.89 
 
 
503 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00210  hypothetical protein  23.66 
 
 
494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01681  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00130)  21.19 
 
 
519 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235626  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02590  MFS transporter, putative  22.53 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10267  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15730)  23.47 
 
 
554 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.213096 
 
 
-
 
NC_006686  CND04960  conserved hypothetical protein  22.63 
 
 
533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09000  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14670)  21.68 
 
 
499 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08955  hypothetical protein  23.98 
 
 
473 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04560  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 
559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07648  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00840)  23.4 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000132828  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00110  hypothetical protein  24.12 
 
 
537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03776  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01840)  23.58 
 
 
532 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  24.14 
 
 
432 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
441 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  27.03 
 
 
440 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
441 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09294  hypothetical protein  23.09 
 
 
449 aa  114  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00338794  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10428  conserved hypothetical protein  22.41 
 
 
491 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152123  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00440  hypothetical protein  22.37 
 
 
526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03503  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06550)  22.27 
 
 
547 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0344857  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03221  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01000)  21.49 
 
 
510 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  26.43 
 
 
440 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  26.73 
 
 
440 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  29.39 
 
 
439 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  23.78 
 
 
433 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  26.18 
 
 
440 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  26.18 
 
 
440 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08996  conserved hypothetical protein  21.28 
 
 
518 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02070  nicotinamide mononucleotide permease, putative  25.93 
 
 
499 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10662  conserved hypothetical protein  21.95 
 
 
426 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000601095 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00811  MFS allantoate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14700)  22.89 
 
 
520 aa  107  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000161001  normal  0.974236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  28.88 
 
 
440 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61879  Transporter of Nicotinic Acid  22.98 
 
 
523 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.110717  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  29.1 
 
 
440 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09456  MFS allantoate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03720)  20.79 
 
 
494 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100188  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05340  hypothetical protein  20.62 
 
 
511 aa  104  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.45 
 
 
442 aa  104  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  29.68 
 
 
428 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
454 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00614  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
507 aa  103  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252734  normal  0.815893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
454 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08502  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01370)  22.47 
 
 
503 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0656476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  22.75 
 
 
432 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01470  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 
549 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.658251  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  27.5 
 
 
459 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  24.6 
 
 
432 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  25 
 
 
436 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  24.68 
 
 
444 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02850  hypothetical protein  22.38 
 
 
501 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.374748  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05291  conserved hypothetical protein  22.75 
 
 
499 aa  101  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  29.06 
 
 
437 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  26.27 
 
 
437 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  27.5 
 
 
474 aa  100  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08814  MFS allantoate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09470)  24.11 
 
 
529 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07027  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04250)  21.88 
 
 
455 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05545  conserved hypothetical protein  24.84 
 
 
503 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08936  conserved hypothetical protein  23.39 
 
 
465 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.57244  normal  0.266871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  24.7 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>