13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34117 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_34117  predicted protein  100 
 
 
516 aa  1050    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00012281  normal  0.103056 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10377  DUF580 domain protein Pns1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12970)  42.01 
 
 
533 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.173426  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00640  integral to plasma membrane protein, putative  39.27 
 
 
551 aa  323  3e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46998  predicted protein  26.67 
 
 
480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291299  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13553  predicted protein  30.17 
 
 
250 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0118726  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32929  predicted protein  27.45 
 
 
794 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_5491  predicted protein  33.8 
 
 
210 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.223661  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36842  predicted protein  22.22 
 
 
762 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36848  predicted protein  21.28 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1302  predicted protein  22.35 
 
 
687 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.12515  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27894  predicted protein  22.82 
 
 
566 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.404888  normal  0.456946 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00800  expressed protein  24.73 
 
 
699 aa  54.3  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45782  predicted protein  25.43 
 
 
658 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>