34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32238 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  100 
 
 
502 aa  1042    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  35.19 
 
 
586 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  31.12 
 
 
507 aa  172  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.7 
 
 
378 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.59 
 
 
889 aa  86.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  23.83 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.32 
 
 
626 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  26 
 
 
628 aa  84  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.49 
 
 
428 aa  84  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  30 
 
 
632 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  24.9 
 
 
429 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.93 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.26 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.26 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.26 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.18 
 
 
457 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  24.4 
 
 
606 aa  70.1  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.43 
 
 
1034 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.16 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.13 
 
 
1074 aa  67  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.43 
 
 
1034 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.05 
 
 
440 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.87 
 
 
446 aa  60.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.47 
 
 
1061 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.04 
 
 
432 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  24.55 
 
 
356 aa  53.5  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.9 
 
 
773 aa  52.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.78 
 
 
379 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.26 
 
 
824 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.11 
 
 
406 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.22 
 
 
563 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.93 
 
 
557 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.44 
 
 
553 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.78 
 
 
631 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>