49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32120 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32120  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  100 
 
 		 452 aa  907    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.506951  normal  0.0756506 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  38.43 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01551  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD29]  35.36 
 
 		 555 aa  172  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.550208  normal  0.0387764 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  37.41 
 
 		 303 aa  169  9e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  28.68 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 885 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  28.4 
 
 		 536 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  25.93 
 
 		 869 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  27.35 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  28.23 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 		 895 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  28.78 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  27.46 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 899 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 919 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.76 
 
 		 842 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  26.84 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  25.33 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  28.64 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  28.57 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  25 
 
 		 522 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  24.61 
 
 		 521 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  26.83 
 
 		 895 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  27.71 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  24.22 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  25.31 
 
 		 863 aa  63.9  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 531 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 		 868 aa  63.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 859 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 905 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 		 889 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 903 aa  60.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 		 917 aa  60.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 862 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  23.94 
 
 		 863 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 		 863 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 		 863 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  22.39 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  25.85 
 
 		 555 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  23.13 
 
 		 540 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  23.7 
 
 		 944 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 		 831 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  26.75 
 
 		 650 aa  54.3  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 529 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  26.16 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 295 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  26.12 
 
 		 649 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07950  Beta-1,3-endoglucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUT0]  24.44 
 
 		 465 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000158341  normal  0.358394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>