38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32024 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_32024  highly conserved hypothetical protein Predicted RNA-binding  100 
 
 
1038 aa  2122    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.873906  normal  0.425602 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10769  DUF814 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09170)  34.02 
 
 
1100 aa  406  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0496389  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88476  predicted protein  24.48 
 
 
1069 aa  196  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289922  normal  0.626674 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42643  predicted protein  31.39 
 
 
1238 aa  129  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0157  hypothetical protein  27.78 
 
 
601 aa  96.3  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0273927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1177  protein of unknown function DUF814  30.63 
 
 
609 aa  92.8  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0662  protein of unknown function DUF814  33.09 
 
 
589 aa  85.1  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1575  hypothetical protein  26.34 
 
 
797 aa  82.4  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842074  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0175  hypothetical protein  29.27 
 
 
650 aa  81.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.432348 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1391  hypothetical protein  24.79 
 
 
663 aa  77  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0603621  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1534  hypothetical protein  27.98 
 
 
641 aa  75.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101346  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1330  hypothetical protein  30.88 
 
 
631 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.507535 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1690  hypothetical protein  28.35 
 
 
614 aa  75.1  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.0000220008  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0509  hypothetical protein  28.72 
 
 
613 aa  74.7  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0655973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0745  hypothetical protein  27.64 
 
 
610 aa  71.6  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0055  hypothetical protein  26.77 
 
 
652 aa  71.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0563  hypothetical protein  25.98 
 
 
686 aa  71.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.181416  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0936  hypothetical protein  28.78 
 
 
632 aa  70.1  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0251474  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0351  hypothetical protein  28.5 
 
 
680 aa  69.7  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0281  hypothetical protein  29.55 
 
 
680 aa  69.3  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000238362 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0566  hypothetical protein  29.55 
 
 
680 aa  68.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.415029  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1632  hypothetical protein  29.55 
 
 
680 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1780  hypothetical protein  29.29 
 
 
616 aa  68.6  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000813258 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0540  hypothetical protein  26.47 
 
 
642 aa  67.4  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0523546  normal  0.309902 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1566  protein of unknown function DUF814  30.08 
 
 
629 aa  67  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.853541  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2928  Fibronectin-binding A domain protein  25.36 
 
 
707 aa  67  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256902  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2189  Fibronectin-binding A domain protein  23.77 
 
 
708 aa  65.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0437  hypothetical protein  29.2 
 
 
627 aa  64.7  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262278  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1479  Fibronectin-binding A domain protein  25.9 
 
 
733 aa  64.7  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0866  Fibronectin-binding A domain protein  23.94 
 
 
727 aa  61.6  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2853  Fibronectin-binding A domain protein  23.91 
 
 
723 aa  59.3  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1592  hypothetical protein  25.27 
 
 
613 aa  55.1  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1823  Fibronectin-binding A domain protein  28.77 
 
 
585 aa  47.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09780  Fibronectin-binding A domain protein  28.97 
 
 
585 aa  46.2  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1691  fibronectin-binding A domain-containing protein  27.37 
 
 
592 aa  45.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1077  fibronectin-binding protein  35.71 
 
 
547 aa  45.1  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.224982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2332  Fibronectin-binding A domain protein  32.35 
 
 
595 aa  44.7  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1297  fibronectin-binding A domain-containing protein  35.64 
 
 
586 aa  44.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>