More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31831 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  100 
 
 		 129 aa  266  5e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  44.64 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  43 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  47.19 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  46.84 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  40 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  45.68 
 
 		 101 aa  84.3  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  43.48 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  36.08 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  44.21 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  48.65 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  41.3 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  46.75 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  46.75 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  46.75 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  46.75 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  46.75 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  46.75 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  46.75 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  46.75 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  46.75 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  40.43 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  40.43 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  40.43 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  37.9 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  44.59 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  35.05 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  45.45 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  42.7 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  35.05 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  45.45 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  45.45 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  45.45 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  45.45 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  44.71 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  33.66 
 
 		 330 aa  77.8  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  44.16 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  42.19 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  38.55 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  39.33 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  42.31 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  41.56 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  43.18 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  44.59 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  50 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  43.62 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  44.59 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  43.21 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  50 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  45.68 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  40 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  43.42 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  43.06 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  39.33 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  42.11 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  43.24 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  41.46 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  42.67 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  39.47 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  36.27 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  36.56 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  40.86 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  40.22 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  49.28 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  43.84 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  42.65 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  40.74 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  42.47 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  42.47 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  42.47 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  43.24 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  42.19 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  43.75 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  43.75 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  42.47 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  45.95 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  48.57 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  45.59 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  41.98 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  46.38 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  36.36 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  42.47 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  42.11 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  44 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  46.58 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  40.54 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  43.21 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  44.29 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  40.62 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  40.74 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  40.3 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  37.5 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  39.19 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  44.93 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  39.74 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  41.67 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  42.35 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  47.83 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>