More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31554 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_31554  replication factor ATPase  100 
 
 		 786 aa  1619    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000494738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  38.46 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  39.42 
 
 		 457 aa  157  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  41.86 
 
 		 427 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  38.39 
 
 		 447 aa  156  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  39.05 
 
 		 457 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  39.25 
 
 		 447 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  37.33 
 
 		 455 aa  155  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  36.36 
 
 		 459 aa  155  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  38.84 
 
 		 425 aa  155  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  38.7 
 
 		 457 aa  154  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  39.81 
 
 		 439 aa  154  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  38.17 
 
 		 423 aa  154  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  38.86 
 
 		 481 aa  154  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  39.42 
 
 		 457 aa  154  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61628  DNA-dependent ATPase MGS1 (Maintenance of genome stability protein 1) DNA-directed DNA polymerase ATPase  38.64 
 
 		 747 aa  153  8.999999999999999e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.17782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  40.55 
 
 		 445 aa  153  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  36.87 
 
 		 428 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  39.45 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  38.68 
 
 		 439 aa  153  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  36.89 
 
 		 445 aa  152  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 443 aa  151  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  38.89 
 
 		 439 aa  151  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  39.91 
 
 		 453 aa  151  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 423 aa  151  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  38.99 
 
 		 435 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  38.25 
 
 		 463 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  39.45 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  40.18 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  38.29 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.87 
 
 		 739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  40.37 
 
 		 437 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  38.14 
 
 		 455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  39.27 
 
 		 425 aa  149  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  36.1 
 
 		 462 aa  148  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  38.29 
 
 		 437 aa  149  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  38.32 
 
 		 441 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  39.15 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  39.15 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  39.15 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  35.87 
 
 		 443 aa  147  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  40.27 
 
 		 434 aa  147  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  37.6 
 
 		 449 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  38.32 
 
 		 441 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  38.6 
 
 		 441 aa  147  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  40.09 
 
 		 436 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  35.19 
 
 		 432 aa  147  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  36.53 
 
 		 461 aa  147  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05617  DNA replication ATPase (Eurofung)  38.81 
 
 		 528 aa  146  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00143305  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  38.53 
 
 		 435 aa  146  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1327  recombination factor protein RarA  39.72 
 
 		 469 aa  146  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  39.63 
 
 		 426 aa  147  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.44 
 
 		 734 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  37.07 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  37.66 
 
 		 442 aa  146  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  35.81 
 
 		 445 aa  146  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  34.29 
 
 		 485 aa  146  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  37.96 
 
 		 435 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2757  recombination factor protein RarA  32.49 
 
 		 511 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  35.59 
 
 		 453 aa  145  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  38.14 
 
 		 435 aa  145  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  39.53 
 
 		 447 aa  145  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  38.52 
 
 		 444 aa  145  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  39.63 
 
 		 435 aa  145  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  36 
 
 		 440 aa  145  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  39.65 
 
 		 436 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  39.09 
 
 		 446 aa  145  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  39.91 
 
 		 433 aa  145  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  37.33 
 
 		 420 aa  145  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  39.64 
 
 		 436 aa  144  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.99 
 
 		 734 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  35.16 
 
 		 444 aa  144  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 434 aa  144  6e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  40.64 
 
 		 434 aa  144  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  38.22 
 
 		 442 aa  144  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  38.14 
 
 		 458 aa  144  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  35.84 
 
 		 440 aa  144  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  37.85 
 
 		 440 aa  144  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  33.92 
 
 		 726 aa  144  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  37.04 
 
 		 437 aa  144  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  35.94 
 
 		 441 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  37.04 
 
 		 437 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  37.33 
 
 		 442 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  36.57 
 
 		 447 aa  143  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  36.7 
 
 		 444 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  34.04 
 
 		 455 aa  143  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  38.36 
 
 		 430 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  35.93 
 
 		 425 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.35 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  34.98 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  39.45 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  37.21 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  37.21 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  37.04 
 
 		 437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  35.48 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  35.48 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0103  recombination factor protein RarA  37.73 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  37.21 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  38.32 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>