142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31021 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  100 
 
 		 1063 aa  2166    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  26.68 
 
 		 1146 aa  329  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  27.75 
 
 		 1125 aa  325  3e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  26.41 
 
 		 1060 aa  281  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28237  predicted protein  36.41 
 
 		 220 aa  133  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.359759  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  24.09 
 
 		 1099 aa  98.2  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  32.07 
 
 		 1076 aa  91.3  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08742  structural maintenance of chromosome complex subunit SmcA (AFU_orthologue; AFUA_6G02700)  30.6 
 
 		 1185 aa  79.7  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183997  normal  0.16607 
 
 
-
 
NC_006686  CND06390  nucleus protein, putative  32.28 
 
 		 1157 aa  76.6  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30460  structural maintenance of chromosomes protein  34.19 
 
 		 1093 aa  76.3  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.157057 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  38.96 
 
 		 891 aa  58.5  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  26.71 
 
 		 702 aa  56.2  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  23.09 
 
 		 935 aa  56.2  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  37.18 
 
 		 864 aa  55.8  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 702 aa  55.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  31.45 
 
 		 572 aa  55.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  28.23 
 
 		 702 aa  55.5  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  19.58 
 
 		 1173 aa  53.5  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  30.54 
 
 		 1187 aa  53.5  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  23.61 
 
 		 1190 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  26.99 
 
 		 1153 aa  53.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.93 
 
 		 1185 aa  53.1  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  31.71 
 
 		 1225 aa  53.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1172 aa  52.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  28.69 
 
 		 1188 aa  52  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.05 
 
 		 1194 aa  52  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  28.05 
 
 		 1007 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.75 
 
 		 1198 aa  51.6  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  29.2 
 
 		 1171 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.48 
 
 		 1174 aa  50.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  31.5 
 
 		 1148 aa  50.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  27.59 
 
 		 1195 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  27.59 
 
 		 1222 aa  50.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 		 1187 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  34.85 
 
 		 406 aa  50.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.72 
 
 		 1201 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  31.43 
 
 		 1172 aa  50.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  28.45 
 
 		 1213 aa  49.7  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  22.36 
 
 		 1193 aa  49.7  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  28.21 
 
 		 1198 aa  49.7  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 557 aa  49.7  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  23.37 
 
 		 1208 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  34.48 
 
 		 1074 aa  49.3  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.11 
 
 		 1191 aa  49.3  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  22.66 
 
 		 1181 aa  49.3  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  32.14 
 
 		 895 aa  48.9  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.34 
 
 		 1196 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  36.11 
 
 		 912 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.71 
 
 		 1196 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  30.67 
 
 		 858 aa  48.9  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1391  SMC domain protein  35.62 
 
 		 526 aa  48.9  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  30 
 
 		 1217 aa  48.5  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.99 
 
 		 1186 aa  48.5  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  21.23 
 
 		 1187 aa  48.5  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0044  P115 protein  32.63 
 
 		 815 aa  48.5  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  41.67 
 
 		 1196 aa  48.5  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_19472  predicted protein  25.62 
 
 		 1186 aa  48.5  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222049  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 		 1198 aa  48.5  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  29.11 
 
 		 1195 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  29.11 
 
 		 1195 aa  48.1  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  29.11 
 
 		 1195 aa  48.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.17 
 
 		 1189 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  28.22 
 
 		 1008 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  33.33 
 
 		 1195 aa  47.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  35.71 
 
 		 565 aa  47.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  27.6 
 
 		 1199 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 		 1218 aa  47.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  25.57 
 
 		 1227 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  24.07 
 
 		 1186 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  27.2 
 
 		 1191 aa  48.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  30.19 
 
 		 561 aa  47.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  27.93 
 
 		 554 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  29.17 
 
 		 1225 aa  47.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.17 
 
 		 1189 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.17 
 
 		 1189 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.17 
 
 		 1189 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.47 
 
 		 1189 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.73 
 
 		 370 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  34.78 
 
 		 421 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  23.44 
 
 		 1183 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  21.49 
 
 		 1185 aa  47  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1204 aa  47  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  41.67 
 
 		 1202 aa  47  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  22.99 
 
 		 1016 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  42 
 
 		 440 aa  47.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  27.91 
 
 		 565 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  29.03 
 
 		 1224 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  26.36 
 
 		 529 aa  47  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.14 
 
 		 1207 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  21.95 
 
 		 924 aa  46.6  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.47 
 
 		 1189 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  22.16 
 
 		 1217 aa  47.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.47 
 
 		 1189 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  25.86 
 
 		 1183 aa  46.2  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  34.18 
 
 		 582 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1184 aa  46.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  26.32 
 
 		 700 aa  46.2  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 555 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  34.15 
 
 		 987 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>