More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28263 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  100 
 
 		 338 aa  685    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  27.62 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04700  thiol-disulfide exchange intermediate, putative  27.42 
 
 		 326 aa  93.6  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  34.44 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  36.17 
 
 		 105 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  36.36 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  32.93 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  38.54 
 
 		 104 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  37.5 
 
 		 165 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  33 
 
 		 117 aa  72  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  31.87 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  32.29 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  35.37 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  32.18 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  32.97 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  33.72 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  38.36 
 
 		 108 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  32.56 
 
 		 113 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  30.68 
 
 		 135 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  34.34 
 
 		 107 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  34.34 
 
 		 107 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  35.24 
 
 		 104 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  35.48 
 
 		 114 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  30.19 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  34.74 
 
 		 119 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  36.47 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  31.76 
 
 		 133 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  30.63 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  34.26 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  34.38 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  37.18 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  31.87 
 
 		 103 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  31.58 
 
 		 119 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  41.03 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  30.59 
 
 		 110 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  30.12 
 
 		 107 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  31.52 
 
 		 108 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  32 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  32.74 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  35.96 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  33.72 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  34.23 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.57 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  30.69 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  36.59 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  36.59 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  34.02 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  34.02 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  38.36 
 
 		 768 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  34.74 
 
 		 120 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1831  thioredoxin  38.46 
 
 		 116 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  35.53 
 
 		 107 aa  65.1  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  34.41 
 
 		 104 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  33.03 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  34.41 
 
 		 104 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  32.32 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  32.65 
 
 		 109 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  33.67 
 
 		 105 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  33.72 
 
 		 109 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  28.57 
 
 		 102 aa  64.7  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  37.93 
 
 		 89 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  37.18 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  37.21 
 
 		 105 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  34.18 
 
 		 98 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  34.41 
 
 		 104 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  33.72 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  37.36 
 
 		 88 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  32.56 
 
 		 109 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  32.93 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  32 
 
 		 105 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  32.93 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  28.05 
 
 		 109 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  33.33 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  31.73 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  27.71 
 
 		 110 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  34.44 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  33.72 
 
 		 104 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  33.73 
 
 		 107 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>