More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_16647 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  100 
 
 		 537 aa  1077    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  42.51 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  39.84 
 
 		 530 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  31.46 
 
 		 542 aa  269  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  30.74 
 
 		 547 aa  233  5e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  29.34 
 
 		 520 aa  203  6e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  26.73 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.98 
 
 		 532 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  25.64 
 
 		 576 aa  187  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  26.96 
 
 		 571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  30.91 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 528 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 514 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  29.57 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  26.25 
 
 		 526 aa  173  6.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  28.34 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  24.75 
 
 		 570 aa  163  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  24.68 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  26.02 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.78 
 
 		 507 aa  158  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 514 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  26.18 
 
 		 544 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  23.66 
 
 		 518 aa  146  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  27.22 
 
 		 514 aa  146  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  23.75 
 
 		 521 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  25.91 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 527 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  24.67 
 
 		 510 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.71 
 
 		 532 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  25.19 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 522 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  24.66 
 
 		 547 aa  123  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  22.59 
 
 		 538 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  24.31 
 
 		 570 aa  117  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.32 
 
 		 527 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  25.73 
 
 		 523 aa  113  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.57 
 
 		 553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  23.06 
 
 		 502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  23.59 
 
 		 505 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 543 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.73 
 
 		 517 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 520 aa  97.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.62 
 
 		 499 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  22.66 
 
 		 505 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  21.51 
 
 		 506 aa  90.5  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  20.76 
 
 		 494 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  23.36 
 
 		 538 aa  87  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  22.88 
 
 		 764 aa  83.6  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  25.88 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  21.48 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  21.63 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  22.47 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  21.48 
 
 		 539 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  21.71 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  21.98 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  21.98 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  21.67 
 
 		 527 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  22.19 
 
 		 496 aa  72  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  21.71 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  22.88 
 
 		 465 aa  72  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  20.04 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  23.59 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  21.63 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  25.23 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  22.27 
 
 		 562 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  22.87 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  21.66 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  20.7 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.04 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  21.83 
 
 		 504 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  24.32 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01702  conserved hypothetical protein  22.36 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0232307  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  20.7 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  20.7 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  20.34 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  20.41 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  20.41 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  20.41 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  20.7 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  20.6 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  20.18 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  20.18 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  21.12 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  21.34 
 
 		 480 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>