18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_15898 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_15898  predicted protein  100 
 
 
674 aa  1375    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.062814  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  30 
 
 
1051 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  29.93 
 
 
1076 aa  130  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  29.94 
 
 
940 aa  80.5  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0509505 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01510  mic1-like protein, putative  25.6 
 
 
1053 aa  74.3  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  27.6 
 
 
230 aa  73.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  23.97 
 
 
1120 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.988868 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  26.9 
 
 
845 aa  67.8  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85313  predicted protein  25.08 
 
 
658 aa  65.1  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.653403 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86304  GTPase activating protein (GAP)  23.73 
 
 
938 aa  63.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  24.73 
 
 
300 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2527  predicted protein  27.41 
 
 
333 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  24.61 
 
 
440 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  23.32 
 
 
872 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0970928 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  23.08 
 
 
641 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  22.69 
 
 
647 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  26.04 
 
 
318 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31816  predicted protein  24.56 
 
 
554 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0623295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>