70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_11329 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_11329  methionine permease  100 
 
 		 459 aa  905    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.408127 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01631  methionine transporter (Eurofung)  36.3 
 
 		 540 aa  276  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.281549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69488  high affinity methionine permease  34.13 
 
 		 551 aa  256  5e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.649926  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02560  methionine transporter, putative (Eurofung)  31.24 
 
 		 560 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.503958 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09490  methionine transporter (Eurofung)  30.53 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.769842 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28954  very low affinity methionine permease  29.64 
 
 		 550 aa  186  6e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144807  normal  0.597745 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07243  methionine transporter, putative (Eurofung)  31.71 
 
 		 557 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.366956  normal  0.430438 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10319  amino acid transporter (Eurofung)  29.48 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204416  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00310  high-affinity methionine permease, putative  29.71 
 
 		 582 aa  147  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09300  amino acid transporter (Eurofung)  26.8 
 
 		 614 aa  143  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917977  normal  0.922161 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45036  high affinity methionine permease  25.37 
 
 		 522 aa  140  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245416  normal  0.788743 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  27.4 
 
 		 580 aa  84  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  25.77 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  24.91 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  22.6 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  22.6 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  22.95 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  22.6 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  22.6 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  24.31 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  22.6 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  22.6 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  22.6 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  22.09 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  22.26 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  24.45 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  24.57 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  21.3 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  20.75 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  23.03 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  23.51 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 474 aa  53.9  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  20.9 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.62 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12010  permease  24.54 
 
 		 481 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2830  amino acid permease family protein  23.33 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  22.76 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  20.74 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  25.25 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  20.56 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  20.75 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1788  amino acid transporter  24.18 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000134575  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  20.75 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  20.75 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  20.75 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  25.24 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  20.75 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  20.75 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  22.44 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 543 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  20.75 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  21.38 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  22.53 
 
 		 740 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  21.53 
 
 		 522 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>