181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_54192 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  100 
 
 		 1099 aa  2268    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  28.15 
 
 		 1076 aa  327  6e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08742  structural maintenance of chromosome complex subunit SmcA (AFU_orthologue; AFUA_6G02700)  28.21 
 
 		 1185 aa  302  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183997  normal  0.16607 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30460  structural maintenance of chromosomes protein  24.16 
 
 		 1093 aa  260  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.157057 
 
 
-
 
NC_006686  CND06390  nucleus protein, putative  26.01 
 
 		 1157 aa  257  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  23.74 
 
 		 1125 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  22.9 
 
 		 1146 aa  98.2  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  23.92 
 
 		 1063 aa  92.8  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  29.11 
 
 		 1060 aa  70.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  28.26 
 
 		 1174 aa  59.3  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1485  SMC domain protein  24.67 
 
 		 952 aa  58.2  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 		 1170 aa  55.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  24.09 
 
 		 1154 aa  55.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  24.91 
 
 		 1196 aa  55.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  23.35 
 
 		 1356 aa  55.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  33.64 
 
 		 1074 aa  55.1  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  24.55 
 
 		 1154 aa  55.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  24.74 
 
 		 1186 aa  54.3  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  26.11 
 
 		 1185 aa  53.5  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1185 aa  53.5  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  26.29 
 
 		 1219 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  26.59 
 
 		 483 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  28.93 
 
 		 1195 aa  53.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  31.87 
 
 		 702 aa  52.8  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  30.19 
 
 		 1208 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1189 aa  52.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  24.04 
 
 		 1184 aa  52.8  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  27.22 
 
 		 1190 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  26.47 
 
 		 1191 aa  52.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  31.53 
 
 		 1154 aa  52.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  33.72 
 
 		 902 aa  52.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  26.97 
 
 		 1031 aa  52  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 700 aa  51.6  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  35.9 
 
 		 1154 aa  51.6  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  32.58 
 
 		 987 aa  50.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1181 aa  51.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1225  DNA replication and repair protein RecF  48.84 
 
 		 349 aa  50.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.193168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  29.38 
 
 		 1176 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  32.93 
 
 		 1080 aa  50.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  31.46 
 
 		 891 aa  51.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  26.88 
 
 		 1023 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 		 1168 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  23.04 
 
 		 1154 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  30.77 
 
 		 702 aa  50.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  24.43 
 
 		 1148 aa  50.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  34.09 
 
 		 895 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  32.1 
 
 		 891 aa  50.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  37.31 
 
 		 1174 aa  50.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  26.61 
 
 		 864 aa  49.7  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  42.55 
 
 		 702 aa  49.7  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  31.52 
 
 		 987 aa  49.3  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  26.29 
 
 		 1175 aa  49.3  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 		 1170 aa  49.3  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  27.4 
 
 		 1146 aa  48.9  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  41.51 
 
 		 1225 aa  48.9  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.26 
 
 		 1187 aa  48.9  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  24.23 
 
 		 1153 aa  48.9  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.95 
 
 		 1191 aa  48.5  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  32.58 
 
 		 789 aa  48.5  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  32.88 
 
 		 924 aa  48.9  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  29.57 
 
 		 1029 aa  48.5  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  25 
 
 		 1032 aa  48.5  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  29.57 
 
 		 1029 aa  48.5  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  29.57 
 
 		 1029 aa  48.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  29.57 
 
 		 1029 aa  48.5  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  29.57 
 
 		 1029 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  29.57 
 
 		 1029 aa  48.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  44.68 
 
 		 440 aa  48.5  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  26.36 
 
 		 1185 aa  48.1  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  43.75 
 
 		 693 aa  48.1  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  29.57 
 
 		 1029 aa  48.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1185 aa  48.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1084  ATPase  21.62 
 
 		 513 aa  47.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.432799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  26.97 
 
 		 1187 aa  47.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  42.55 
 
 		 1191 aa  47.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  23.65 
 
 		 1187 aa  47.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  43.48 
 
 		 406 aa  47.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  29.63 
 
 		 1240 aa  48.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  38.3 
 
 		 371 aa  48.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  32.63 
 
 		 1003 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  21.99 
 
 		 1201 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  29.57 
 
 		 1029 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  24.28 
 
 		 978 aa  47.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1164 aa  47.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  42.42 
 
 		 1198 aa  48.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.67 
 
 		 626 aa  47.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  25.41 
 
 		 1476 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0003  recombination protein F  37.84 
 
 		 364 aa  47  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.26612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 		 1172 aa  47  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  23.77 
 
 		 1171 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0003  recombination protein F  37.84 
 
 		 364 aa  47.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0185053  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  40.43 
 
 		 1189 aa  47  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  46.67 
 
 		 912 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  28.89 
 
 		 994 aa  47  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  40.43 
 
 		 1189 aa  47  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  31.03 
 
 		 1029 aa  47.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  27.7 
 
 		 1200 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  32.84 
 
 		 1018 aa  46.6  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  43.75 
 
 		 360 aa  47  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  40.43 
 
 		 1189 aa  47  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>