More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_5396 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  100 
 
 
165 aa  335  1e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  44.85 
 
 
342 aa  139  2e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  46.06 
 
 
337 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.82338e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
365 aa  137  8e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.38973e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  46.67 
 
 
348 aa  135  3e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  2.88065e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  45.45 
 
 
338 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.16852e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  44.85 
 
 
339 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  47.27 
 
 
338 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.1118e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  47.27 
 
 
330 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.78362e-06  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  47.27 
 
 
338 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.22492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  43.03 
 
 
349 aa  134  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
340 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  47.27 
 
 
338 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.60799e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  43.03 
 
 
353 aa  134  7e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  2.85162e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
332 aa  132  2e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  6.96502e-10 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  43.9 
 
 
343 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.80746e-07  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  43.03 
 
 
340 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  44.24 
 
 
356 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  43.03 
 
 
340 aa  131  4e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  44.24 
 
 
342 aa  130  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.59076e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  45.45 
 
 
348 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  45.45 
 
 
348 aa  131  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  45.45 
 
 
348 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  41.21 
 
 
312 aa  130  7e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  41.21 
 
 
312 aa  130  8e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  43.03 
 
 
339 aa  129  1e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  43.03 
 
 
339 aa  129  1e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  45.45 
 
 
348 aa  129  1e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  43.03 
 
 
339 aa  130  1e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  45.45 
 
 
348 aa  130  1e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
338 aa  129  2e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.34628e-08  unclonable  7.65641e-11 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
353 aa  129  2e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.8636e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
326 aa  129  2e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
338 aa  129  2e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
324 aa  129  2e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  43.03 
 
 
339 aa  129  2e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
343 aa  129  2e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
337 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.73214e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  44.24 
 
 
335 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
338 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29962e-06  unclonable  2.62337e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
338 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.01356e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  44.24 
 
 
353 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.39e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
341 aa  127  7e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
353 aa  127  8e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
341 aa  127  9e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  44.24 
 
 
348 aa  126  1e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  44.24 
 
 
353 aa  126  1e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  44.24 
 
 
348 aa  126  2e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  44.85 
 
 
332 aa  124  4e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  43.03 
 
 
336 aa  124  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  41.82 
 
 
349 aa  124  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  42.42 
 
 
349 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  40 
 
 
347 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
349 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40347e-14 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
349 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
349 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  3.87336e-07 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
349 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.80069e-08 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  39.39 
 
 
325 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
349 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  42.42 
 
 
349 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
349 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  44.24 
 
 
334 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  44.24 
 
 
334 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  43.03 
 
 
347 aa  121  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  3.53353e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
343 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.70796e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  43.64 
 
 
334 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  39.39 
 
 
347 aa  119  2e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  40.85 
 
 
348 aa  119  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.383e-07 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  40.85 
 
 
348 aa  119  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.37079e-13 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  40.85 
 
 
348 aa  119  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17623e-10 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  40.85 
 
 
348 aa  119  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  40.85 
 
 
348 aa  119  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
344 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  41.21 
 
 
349 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  40.61 
 
 
333 aa  114  7e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  42.42 
 
 
347 aa  113  1e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  38.18 
 
 
340 aa  112  2e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  41.21 
 
 
234 aa  108  4e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  36.36 
 
 
338 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  36.36 
 
 
338 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  38.55 
 
 
364 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  37.95 
 
 
364 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  37.27 
 
 
267 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  36.24 
 
 
216 aa  99.8  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  39.75 
 
 
285 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  34.78 
 
 
300 aa  99.8  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  35.54 
 
 
378 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  36.53 
 
 
327 aa  96.3  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  36.81 
 
 
297 aa  95.5  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.97 
 
 
335 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  36.65 
 
 
265 aa  94.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.13 
 
 
350 aa  94  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  33.13 
 
 
316 aa  94  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  37.89 
 
 
287 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  36.65 
 
 
265 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  36.02 
 
 
265 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.16 
 
 
298 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.71573e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  39.75 
 
 
286 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  39.75 
 
 
286 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  33.13 
 
 
313 aa  90.5  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>