138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46830 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  100 
 
 
469 aa  989    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  54.48 
 
 
455 aa  517  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  31.37 
 
 
364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  29.79 
 
 
466 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  29.79 
 
 
465 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  30.35 
 
 
371 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  29.68 
 
 
362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  30.13 
 
 
364 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  29.65 
 
 
364 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  25.55 
 
 
356 aa  123  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  29.3 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  29.6 
 
 
426 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  31.05 
 
 
366 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  28.27 
 
 
453 aa  109  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  29.21 
 
 
381 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  30.58 
 
 
366 aa  107  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  28.77 
 
 
491 aa  106  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  28.01 
 
 
363 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  29.55 
 
 
365 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  27.5 
 
 
378 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.62 
 
 
360 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  28.07 
 
 
347 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  26.8 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  26.47 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  27.11 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  24.58 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  27.37 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  30.83 
 
 
342 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  27.36 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  24.44 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  26.64 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  25.89 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  25 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  28.62 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  24.12 
 
 
485 aa  67  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  25.91 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  47.54 
 
 
356 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  21.63 
 
 
354 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  34.56 
 
 
452 aa  64.3  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  27.59 
 
 
358 aa  63.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  23.48 
 
 
517 aa  63.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  42.25 
 
 
401 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  24.86 
 
 
573 aa  63.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  24.24 
 
 
357 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  49.18 
 
 
760 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  26.15 
 
 
346 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  27 
 
 
394 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  23.51 
 
 
434 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  25.45 
 
 
370 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  26.3 
 
 
368 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  45.33 
 
 
345 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  25.67 
 
 
382 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  30 
 
 
357 aa  60.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  25.8 
 
 
321 aa  60.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  24.61 
 
 
361 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  24.61 
 
 
361 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  24.61 
 
 
361 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  24.38 
 
 
382 aa  60.1  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  28.88 
 
 
346 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  31.25 
 
 
364 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  24.47 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  26.76 
 
 
373 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  22.72 
 
 
477 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  25.97 
 
 
368 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  25.66 
 
 
391 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  25.97 
 
 
368 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  25.56 
 
 
377 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  24.47 
 
 
369 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  24.47 
 
 
369 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  24.51 
 
 
369 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  26.12 
 
 
545 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  23.64 
 
 
413 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  37.33 
 
 
469 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  35.87 
 
 
378 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  34.07 
 
 
400 aa  56.6  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  42.03 
 
 
397 aa  56.6  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  25.51 
 
 
365 aa  56.6  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  25.74 
 
 
370 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  23.2 
 
 
363 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  25.91 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  41.43 
 
 
375 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  34.62 
 
 
400 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  25.63 
 
 
372 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  25 
 
 
400 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  27.87 
 
 
535 aa  53.9  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  26.23 
 
 
341 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  26.64 
 
 
370 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  38.24 
 
 
384 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  25.16 
 
 
415 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  24.05 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  41.67 
 
 
464 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  26.72 
 
 
361 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  22.95 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  40.98 
 
 
390 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  41.67 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
418 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  36.23 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  39.19 
 
 
443 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  22.22 
 
 
357 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  36.67 
 
 
464 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>