182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43905 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  100 
 
 		 1038 aa  2152    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  42.62 
 
 		 297 aa  244  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  34.02 
 
 		 521 aa  212  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  31.66 
 
 		 797 aa  170  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  27.73 
 
 		 1077 aa  156  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  31.03 
 
 		 1090 aa  154  8.999999999999999e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  28.16 
 
 		 633 aa  140  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  29.35 
 
 		 611 aa  134  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  27.59 
 
 		 633 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  30.69 
 
 		 609 aa  129  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  30.74 
 
 		 388 aa  128  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  28.57 
 
 		 636 aa  127  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27.56 
 
 		 633 aa  121  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  30.32 
 
 		 479 aa  120  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  28.25 
 
 		 635 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  28.37 
 
 		 466 aa  119  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.25 
 
 		 636 aa  111  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  29.86 
 
 		 655 aa  110  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  27.07 
 
 		 651 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.27 
 
 		 752 aa  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.25 
 
 		 632 aa  110  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  29.66 
 
 		 643 aa  108  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  26.72 
 
 		 1097 aa  108  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  32.31 
 
 		 553 aa  107  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  32.31 
 
 		 553 aa  107  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  28.92 
 
 		 754 aa  104  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  29.24 
 
 		 633 aa  103  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  29 
 
 		 2245 aa  102  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  31.47 
 
 		 629 aa  102  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  26 
 
 		 686 aa  99.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  30.9 
 
 		 1189 aa  100  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  29.71 
 
 		 650 aa  98.6  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1118 aa  98.6  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  28.25 
 
 		 952 aa  98.2  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  29.17 
 
 		 650 aa  98.6  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  26.94 
 
 		 715 aa  98.2  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.43 
 
 		 619 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  25.66 
 
 		 622 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  30.93 
 
 		 315 aa  96.7  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1215 aa  96.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  27.99 
 
 		 464 aa  95.9  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  28.43 
 
 		 622 aa  95.9  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  26.64 
 
 		 606 aa  95.5  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  27.21 
 
 		 934 aa  94.7  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  26.56 
 
 		 1250 aa  94.7  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  27.06 
 
 		 1999 aa  94.7  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  26.94 
 
 		 1143 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  26.94 
 
 		 1143 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  28.74 
 
 		 795 aa  93.2  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.15 
 
 		 986 aa  92.4  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  25.44 
 
 		 902 aa  91.7  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  27.3 
 
 		 716 aa  91.7  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1139 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.6 
 
 		 1082 aa  89.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  25.7 
 
 		 1153 aa  89.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.89 
 
 		 1324 aa  88.6  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  31.64 
 
 		 268 aa  88.6  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  27.29 
 
 		 1143 aa  88.2  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.19 
 
 		 1151 aa  87.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  25 
 
 		 902 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1116 aa  87  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  23.9 
 
 		 585 aa  85.1  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  25.64 
 
 		 1584 aa  84.7  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  26.02 
 
 		 1585 aa  84.7  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  26.02 
 
 		 1585 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1126 aa  83.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1350 aa  83.2  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  26.69 
 
 		 1457 aa  82  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  24.83 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1215 aa  80.9  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  25.94 
 
 		 1163 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  28.12 
 
 		 946 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  24.56 
 
 		 1228 aa  80.5  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  26.4 
 
 		 1653 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.55 
 
 		 1099 aa  79.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.76 
 
 		 1203 aa  78.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  25 
 
 		 1270 aa  78.2  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  25.71 
 
 		 1111 aa  78.2  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  25.96 
 
 		 1403 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  26.37 
 
 		 748 aa  76.3  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  26.35 
 
 		 1041 aa  75.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1172 aa  75.5  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  26.6 
 
 		 1280 aa  75.1  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16728  predicted protein  32.5 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.61 
 
 		 1428 aa  73.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  24.11 
 
 		 1175 aa  73.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  27.1 
 
 		 1620 aa  72.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.27 
 
 		 1048 aa  72  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  23.25 
 
 		 1284 aa  71.6  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  25.54 
 
 		 901 aa  71.6  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  24.21 
 
 		 1196 aa  70.9  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  24.02 
 
 		 1190 aa  70.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  25.35 
 
 		 1408 aa  70.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  25.9 
 
 		 1427 aa  70.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  22.76 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  25.49 
 
 		 1651 aa  68.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  24.75 
 
 		 1198 aa  68.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.53 
 
 		 932 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  26.38 
 
 		 1126 aa  66.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  24.27 
 
 		 922 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>