40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_36940 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_36940  predicted protein  100 
 
 
295 aa  620  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2143  protein of unknown function DUF1349  30.91 
 
 
197 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1147  protein of unknown function DUF1349  29.36 
 
 
199 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  30 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  27.75 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5764  protein of unknown function DUF1349  29.15 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913507  normal  0.562373 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2934  hypothetical protein  30 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404051  hitchhiker  0.0000430397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2399  hypothetical protein  28.7 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1579  protein of unknown function DUF1349  26.85 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157914  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07990  hypothetical protein  34.69 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1749  protein of unknown function DUF1349  45.26 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335138  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2454  hypothetical protein  29.3 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6671  protein of unknown function DUF1349  30.04 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00171031  normal  0.066277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2937  protein of unknown function DUF1349  28.11 
 
 
181 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1176  protein of unknown function DUF1349  29.27 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  27.05 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  28.32 
 
 
211 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4540  hypothetical protein  37.61 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2191  hypothetical protein  26.94 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00552643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  26.44 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3213  protein of unknown function DUF1349  32.12 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2248  hypothetical protein  26.03 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000136964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2442  hypothetical protein  26.94 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0097  protein of unknown function DUF1349  30.66 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000978689  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2274  hypothetical protein  26.94 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2458  hypothetical protein  26.94 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2234  hypothetical protein  26.94 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000537336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2536  hypothetical protein  26.48 
 
 
198 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.278  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1507  protein of unknown function DUF1349  30.56 
 
 
203 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.449634  normal  0.257305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2473  hypothetical protein  26.03 
 
 
198 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0333618  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4314  hypothetical protein  29.73 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0820719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3819  hypothetical protein  33.63 
 
 
191 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4071  hypothetical protein  25.96 
 
 
191 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4328  protein of unknown function DUF1349  32.39 
 
 
193 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.683999  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  24.38 
 
 
193 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15801  predicted protein  30.61 
 
 
178 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4481  hypothetical protein  33.98 
 
 
216 aa  55.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  26.97 
 
 
200 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05960  hypothetical protein  26.15 
 
 
231 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07484  Uncharacterized protein AN7484 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW46]  28.43 
 
 
200 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>