189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33450 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  100 
 
 
500 aa  1034    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  38.35 
 
 
416 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  38.53 
 
 
413 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  36.95 
 
 
431 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  36.04 
 
 
433 aa  256  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  36.71 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  35.91 
 
 
417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  36.61 
 
 
423 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  36.38 
 
 
432 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  35.58 
 
 
426 aa  234  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  37.39 
 
 
426 aa  231  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  35.35 
 
 
427 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  35.1 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  37.28 
 
 
425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  35.31 
 
 
424 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  35.7 
 
 
422 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  33.68 
 
 
432 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  31.87 
 
 
435 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  34.45 
 
 
424 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  36.5 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  35.61 
 
 
442 aa  193  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  34.53 
 
 
476 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  30.67 
 
 
409 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  33.19 
 
 
412 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  30.61 
 
 
409 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  31.83 
 
 
427 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  31.26 
 
 
418 aa  180  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  31.83 
 
 
409 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  31.66 
 
 
414 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  29.56 
 
 
411 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  30 
 
 
411 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  30.93 
 
 
492 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  29.19 
 
 
474 aa  148  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  29.05 
 
 
484 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  28.81 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  29.77 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  28.38 
 
 
485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.49 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.49 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.73 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  25.11 
 
 
493 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  25.1 
 
 
512 aa  67  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  24.24 
 
 
490 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  24.24 
 
 
490 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  23.64 
 
 
483 aa  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  23.81 
 
 
494 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  24.89 
 
 
501 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  25.82 
 
 
496 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  25.8 
 
 
502 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  24.02 
 
 
490 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  24.02 
 
 
490 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  22.78 
 
 
487 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.03 
 
 
518 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  24.45 
 
 
493 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  24.45 
 
 
493 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  24.45 
 
 
493 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  23.09 
 
 
494 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  25.11 
 
 
488 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  26.27 
 
 
438 aa  60.1  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  25.2 
 
 
481 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  23.34 
 
 
499 aa  60.1  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  23.66 
 
 
493 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  23.4 
 
 
499 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  27.24 
 
 
510 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  24.79 
 
 
498 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  22.86 
 
 
484 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  22.86 
 
 
484 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  24.08 
 
 
509 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  21.77 
 
 
488 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  24.14 
 
 
498 aa  57.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  24.63 
 
 
485 aa  57.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  23.14 
 
 
493 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  23.46 
 
 
509 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  22.65 
 
 
484 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  24.02 
 
 
501 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  23.8 
 
 
501 aa  56.6  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  23.54 
 
 
493 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  24.46 
 
 
486 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  23.53 
 
 
492 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  25.61 
 
 
512 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  24.29 
 
 
493 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  23.19 
 
 
491 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  23.7 
 
 
493 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  23.7 
 
 
493 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  21.33 
 
 
511 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  22.89 
 
 
493 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  23.19 
 
 
486 aa  55.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  24.78 
 
 
515 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  22.59 
 
 
496 aa  55.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  23.08 
 
 
506 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  23.08 
 
 
493 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  23.28 
 
 
496 aa  54.3  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  23.38 
 
 
493 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  24.28 
 
 
485 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  23.08 
 
 
486 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  23.75 
 
 
493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  24.62 
 
 
498 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  24.12 
 
 
482 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  21.24 
 
 
517 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  21.43 
 
 
484 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>