More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33356 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_33356  thioredoxin y  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00024318  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37354  predicted protein  38.6 
 
 		 131 aa  91.7  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0644454  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  39.85 
 
 		 117 aa  89  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  36.84 
 
 		 145 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  48 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  35.09 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  46.43 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  37.93 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  39.17 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  36.89 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  47.67 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  38.66 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  45.57 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  47.3 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  47.3 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  36.54 
 
 		 140 aa  77.4  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  47.3 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  47.3 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  47.3 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  42.35 
 
 		 107 aa  77  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  46.05 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  38.33 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  45.95 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  45.95 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  35.71 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  45.95 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  45.95 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  45.95 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  45.95 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  41.67 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  45.95 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  45.95 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  45.95 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  35.71 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  46.05 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  32.47 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  47.3 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  47.95 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  38.38 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  34.82 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  37.61 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  33.93 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  46.58 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  46.58 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  40.7 
 
 		 141 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  43.24 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  41.33 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  38.2 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  46.88 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  37.5 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  38.54 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  41.46 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  32.29 
 
 		 117 aa  73.6  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  34.64 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  37.23 
 
 		 105 aa  72  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0054  thioredoxin, putative  35.25 
 
 		 142 aa  72  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  45.95 
 
 		 139 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  50 
 
 		 140 aa  72  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  41.1 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  34.91 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  34.91 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  35.51 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  48.39 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  37.8 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  38.96 
 
 		 304 aa  70.9  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  44.78 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  35.4 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  38.96 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  40.24 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  40.24 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  36.89 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  41.94 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  34.48 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  32.52 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  33.64 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  38.64 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  46.77 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  40.24 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  39.08 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  36.36 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2360  thioredoxin domain-containing protein  37.14 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177499  hitchhiker  0.00135525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  38.1 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  39.74 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  41.11 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  34.41 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  38 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  48.33 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  41.43 
 
 		 304 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  37 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  33.66 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  38 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  35.09 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  41.98 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  34.38 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  36.89 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  41.03 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>