273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_28245 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_28245  voltage activated chloride channel CLC7 type  100 
 
 
768 aa  1580    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.385606  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_52412  channel voltage activated chloride channel  57.4 
 
 
693 aa  728    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50496  ClC family transporter: chloride ion channel  33.42 
 
 
869 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.913408  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34455  ClC family transporter: chloride ion channel  26.84 
 
 
802 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46097  predicted protein  29.57 
 
 
980 aa  198  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01900  conserved hypothetical protein  27.4 
 
 
873 aa  196  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00397821  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53364  voltage-gated chloride channel  23.86 
 
 
764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14344  ClC family transporter: chloride ion channel  28.88 
 
 
718 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03790  voltage-gated chloride channel, putative  30.11 
 
 
897 aa  180  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02308  ClC chloride ion channel (Eurofung)  27.45 
 
 
828 aa  179  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.382711  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06107  CLC channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870M6]  27.35 
 
 
909 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.20732  normal  0.131172 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57787  voltage-gated protein/chloride channel  28.23 
 
 
869 aa  153  8.999999999999999e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0658005  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06311  ClC chloride ion channel (Eurofung)  27.86 
 
 
793 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83582  chloride channel, possibly voltage gated  27.92 
 
 
818 aa  148  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172936  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  25.97 
 
 
473 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  25.27 
 
 
627 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  25.05 
 
 
473 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  25.05 
 
 
473 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  25.05 
 
 
473 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  25.05 
 
 
473 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.28 
 
 
863 aa  101  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  27.1 
 
 
538 aa  99  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  26.52 
 
 
471 aa  97.4  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  27.53 
 
 
466 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  25.51 
 
 
897 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  34.94 
 
 
563 aa  92.4  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.68 
 
 
470 aa  91.3  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.46 
 
 
526 aa  90.9  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  26.27 
 
 
519 aa  90.5  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  25.06 
 
 
510 aa  89.7  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  26.02 
 
 
519 aa  89.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  25.1 
 
 
879 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  25.1 
 
 
879 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  24.59 
 
 
569 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  24.47 
 
 
627 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.66 
 
 
436 aa  86.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.08 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  26.08 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.08 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  23.4 
 
 
631 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.02 
 
 
582 aa  83.2  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  20.96 
 
 
594 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  23.66 
 
 
463 aa  82  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  29.37 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  23.33 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.47 
 
 
620 aa  80.9  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.27 
 
 
754 aa  80.1  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  36.59 
 
 
512 aa  80.5  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  23.04 
 
 
528 aa  79  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.17 
 
 
587 aa  78.2  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  26.85 
 
 
449 aa  77.8  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  24.35 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  33.33 
 
 
859 aa  77  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  24.11 
 
 
523 aa  77  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  26.68 
 
 
470 aa  77  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  24.94 
 
 
615 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  25.45 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  26.37 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  24.55 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.32 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  25.85 
 
 
669 aa  75.1  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  25.25 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  26.34 
 
 
444 aa  73.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  27.27 
 
 
472 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  21.98 
 
 
580 aa  72.8  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  24.58 
 
 
452 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  25.57 
 
 
523 aa  72.4  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.74 
 
 
875 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  27.25 
 
 
539 aa  72  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  26.57 
 
 
490 aa  72  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  23.57 
 
 
613 aa  72  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  21.66 
 
 
614 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  22.6 
 
 
585 aa  71.6  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  28.65 
 
 
628 aa  71.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  23.29 
 
 
585 aa  71.6  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  30.43 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  23.23 
 
 
457 aa  71.2  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  26.57 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  24.94 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  24.58 
 
 
543 aa  70.5  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  25.62 
 
 
427 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  28.65 
 
 
600 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  24.46 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.61 
 
 
626 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.14 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.73 
 
 
589 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  25.41 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.19 
 
 
628 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  31.77 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  31.44 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1179  voltage-gated chloride channel family protein  27.57 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  31.44 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.55 
 
 
636 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  27.01 
 
 
624 aa  67.4  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.79 
 
 
579 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.79 
 
 
579 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  24.64 
 
 
452 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.79 
 
 
579 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  23.42 
 
 
613 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  24.12 
 
 
455 aa  67  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>