More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_28222 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  100 
 
 
316 aa  644  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  61.13 
 
 
319 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  62.58 
 
 
317 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  61.44 
 
 
318 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  61.76 
 
 
317 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  59.56 
 
 
317 aa  388  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  60.82 
 
 
318 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.61015e-05  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  61.44 
 
 
318 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  59.87 
 
 
318 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  60.82 
 
 
318 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  61.13 
 
 
318 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  61.13 
 
 
318 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.65536e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  60.5 
 
 
318 aa  381  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  61.13 
 
 
318 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.40039e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  60.9 
 
 
320 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  60.19 
 
 
318 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.01503e-07  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  61.13 
 
 
318 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  59.87 
 
 
317 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  61.06 
 
 
316 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  59.87 
 
 
318 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3045  transaldolase B  58.44 
 
 
329 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  58.41 
 
 
324 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  59.56 
 
 
318 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.75704e-05  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  58.13 
 
 
389 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  60 
 
 
387 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  59.25 
 
 
321 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  57.73 
 
 
318 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1834  transaldolase  57.5 
 
 
334 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  60 
 
 
387 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  59.69 
 
 
316 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  58.93 
 
 
321 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  57.14 
 
 
317 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0493  transaldolase B  60.13 
 
 
332 aa  368  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466389  normal  0.164229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  57.14 
 
 
317 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  58.62 
 
 
316 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  59.56 
 
 
317 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  57.46 
 
 
317 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  57.14 
 
 
317 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  57.14 
 
 
317 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1919  transaldolase B  56.6 
 
 
321 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  57.14 
 
 
317 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  57.73 
 
 
318 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  59.56 
 
 
316 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  57.14 
 
 
317 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  56.19 
 
 
317 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  56.19 
 
 
317 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  56.15 
 
 
316 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  58.62 
 
 
316 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.43642e-07  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  56.19 
 
 
317 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  56.51 
 
 
317 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  56.19 
 
 
317 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.86 
 
 
392 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  56.51 
 
 
317 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  56.19 
 
 
317 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0822  transaldolase B  55.7 
 
 
330 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.128995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  56.19 
 
 
338 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  56.19 
 
 
317 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  56.19 
 
 
317 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  56.83 
 
 
317 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  56.19 
 
 
317 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  56.19 
 
 
338 aa  364  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06256  transaldolase B  59.25 
 
 
316 aa  364  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2959  transaldolase A  57.73 
 
 
316 aa  364  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.874274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  57.14 
 
 
310 aa  364  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.65093e-10  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  56.19 
 
 
317 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  56.19 
 
 
317 aa  363  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  59.05 
 
 
315 aa  363  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  56.19 
 
 
317 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  58.04 
 
 
316 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  58.04 
 
 
316 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  58.04 
 
 
316 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  58.04 
 
 
316 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  58.04 
 
 
316 aa  363  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  58.04 
 
 
316 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2297  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  55.76 
 
 
397 aa  362  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  58.04 
 
 
316 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  58.04 
 
 
316 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2149  transaldolase A  55.21 
 
 
316 aa  361  8e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  55.9 
 
 
390 aa  360  2e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  55.62 
 
 
319 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0775  transaldolase B  57.46 
 
 
318 aa  359  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.38826  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  57.73 
 
 
316 aa  359  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  57.78 
 
 
316 aa  359  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  58.41 
 
 
308 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3850  transaldolase B  57.37 
 
 
318 aa  358  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  57.1 
 
 
319 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  57.14 
 
 
308 aa  357  1e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0982  transaldolase A  55.21 
 
 
316 aa  357  1e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  56.78 
 
 
319 aa  357  1e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03170  transaldolase, putative  58.39 
 
 
323 aa  357  1e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0705  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  54.66 
 
 
390 aa  356  3e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  58.41 
 
 
308 aa  356  3e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  2.13936e-05 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05211  transaldolase B  57.14 
 
 
339 aa  355  4e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  58.1 
 
 
308 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  56.01 
 
 
319 aa  355  7e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  57.78 
 
 
309 aa  354  9e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2666  transaldolase A  54.27 
 
 
316 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2839  transaldolase A  54.27 
 
 
316 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2617  transaldolase A  53.96 
 
 
316 aa  353  3e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2706  transaldolase A  53.96 
 
 
316 aa  353  3e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>