More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_28219 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  100 
 
 		 447 aa  915    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  72.52 
 
 		 446 aa  653    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  75.65 
 
 		 429 aa  658    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  68.07 
 
 		 443 aa  627  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  66.44 
 
 		 450 aa  593  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  46.62 
 
 		 407 aa  335  7.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  55.33 
 
 		 398 aa  332  8e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  53.11 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  50.49 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  45.57 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  50.49 
 
 		 407 aa  322  7e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  50.16 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  49.53 
 
 		 422 aa  319  7e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  51.18 
 
 		 407 aa  317  4e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  52.09 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  49.53 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  47.35 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  49.33 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  46.06 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  47.95 
 
 		 412 aa  309  8e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  49.01 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  45.79 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  46.81 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  47.28 
 
 		 393 aa  303  5.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  44.76 
 
 		 443 aa  303  5.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  49.33 
 
 		 394 aa  302  7.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  45.65 
 
 		 421 aa  299  7e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  48.69 
 
 		 412 aa  299  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  51.23 
 
 		 403 aa  299  9e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  51.76 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  47.71 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  49.66 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  48.15 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  43.5 
 
 		 431 aa  296  6e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  51.06 
 
 		 404 aa  295  8e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  50.35 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  41.75 
 
 		 425 aa  293  6e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  51.1 
 
 		 284 aa  291  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  43.77 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  45.81 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  47.45 
 
 		 390 aa  289  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  47.7 
 
 		 405 aa  289  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  50.18 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  47.65 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  49.82 
 
 		 413 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  49.83 
 
 		 406 aa  288  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  45.45 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  52.69 
 
 		 389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  45.09 
 
 		 427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  43.24 
 
 		 407 aa  285  8e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  48.04 
 
 		 386 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  42.42 
 
 		 464 aa  282  8.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  48.94 
 
 		 389 aa  282  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  51.34 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  43.73 
 
 		 465 aa  275  9e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  46.13 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  47.8 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  44.19 
 
 		 434 aa  273  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  45.18 
 
 		 414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  45.45 
 
 		 460 aa  273  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  45.73 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  47.23 
 
 		 417 aa  265  8.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  45.87 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  45.21 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.74 
 
 		 643 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.13 
 
 		 732 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.17 
 
 		 608 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.04 
 
 		 619 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.36 
 
 		 651 aa  233  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.16 
 
 		 639 aa  232  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.99 
 
 		 610 aa  232  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.35 
 
 		 769 aa  231  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.59 
 
 		 610 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.42 
 
 		 738 aa  231  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.35 
 
 		 662 aa  230  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.81 
 
 		 739 aa  230  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.26 
 
 		 768 aa  230  5e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.18 
 
 		 602 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  45.42 
 
 		 654 aa  230  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  48.61 
 
 		 739 aa  229  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.14 
 
 		 656 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.09 
 
 		 673 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.09 
 
 		 673 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  43.85 
 
 		 681 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  45.53 
 
 		 656 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.19 
 
 		 636 aa  226  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.27 
 
 		 679 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.54 
 
 		 737 aa  227  4e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  44.27 
 
 		 682 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.31 
 
 		 653 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  44.4 
 
 		 650 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  44.4 
 
 		 647 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.38 
 
 		 625 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45 
 
 		 672 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.06 
 
 		 640 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.85 
 
 		 607 aa  226  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.85 
 
 		 793 aa  226  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.36 
 
 		 640 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.36 
 
 		 640 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.53 
 
 		 696 aa  226  9e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>