21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_28147 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_28147  predicted protein  100 
 
 		 62 aa  130  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31044  RPS29A; ribosomal protein S29A (S36A) (YS29)  59.62 
 
 		 56 aa  68.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167387  normal  0.57563 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42310  Ribosomal protein S29, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  52.73 
 
 		 56 aa  60.5  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.243143  normal  0.393966 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11411  40S ribosomal protein S29 (Eurofung)  50 
 
 		 56 aa  57.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04290  conserved hypothetical protein  45.45 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.546532  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0015  30S ribosomal protein S14P  53.19 
 
 		 50 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.67188e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0165  30S ribosomal protein S14P  47.06 
 
 		 53 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000451601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1714  ribosomal protein S14  53.19 
 
 		 47 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00614763  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0724  30S ribosomal protein S14P  50 
 
 		 53 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1398  30S ribosomal protein S14P  51.06 
 
 		 53 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0658  30S ribosomal protein S14P  51.11 
 
 		 53 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1260  30S ribosomal protein S14P  51.11 
 
 		 53 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215298  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0578  ribosomal protein S14  46 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0095  30S ribosomal protein S14P  46 
 
 		 56 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.450951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0241  30S ribosomal protein S14P  42.59 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0096  30S ribosomal protein S14P  50 
 
 		 50 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000254546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0456  30S ribosomal protein S14P  44.9 
 
 		 51 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2435  30S ribosomal protein S14P  40.35 
 
 		 57 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2239  30S ribosomal protein S14P  46.81 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000503282  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0546  30S ribosomal protein S14P  46.81 
 
 		 51 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355723  normal  0.314336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2232  ribosomal protein S14  40 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>