More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_21116 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_21116  predicted protein  100 
 
 
418 aa  870    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1045  argininosuccinate synthase  55.99 
 
 
409 aa  484  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1067  argininosuccinate synthase  55.99 
 
 
409 aa  484  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337048  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00700  argininosuccinate synthase, putative  51.32 
 
 
429 aa  450  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0559  Argininosuccinate synthase  50.82 
 
 
430 aa  436  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.487039 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  52.78 
 
 
403 aa  423  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01883  arginosuccinate synthetase (Eurofung)  50.48 
 
 
416 aa  418  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  51.21 
 
 
414 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  52.85 
 
 
399 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34492  argininosuccinate synthetase  50.6 
 
 
416 aa  409  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.491384  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  49.02 
 
 
401 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  49.64 
 
 
397 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  48.42 
 
 
397 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  49.4 
 
 
401 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  49.01 
 
 
408 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  48.4 
 
 
405 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  48.93 
 
 
407 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  49.02 
 
 
409 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  48.4 
 
 
397 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  48.05 
 
 
407 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  49.52 
 
 
403 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  48.76 
 
 
409 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  48.67 
 
 
406 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  47.47 
 
 
406 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  50 
 
 
419 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  47.94 
 
 
405 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  48.31 
 
 
405 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  50.36 
 
 
410 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  46.14 
 
 
411 aa  385  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  48.4 
 
 
400 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  48.27 
 
 
419 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  47.94 
 
 
405 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  46.86 
 
 
410 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  47.7 
 
 
405 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1361  argininosuccinate synthase  48.67 
 
 
407 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.515773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  47.83 
 
 
405 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  47.83 
 
 
406 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  49.38 
 
 
407 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  49.51 
 
 
399 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  48.43 
 
 
407 aa  385  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  48.51 
 
 
403 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  47.7 
 
 
405 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  48.89 
 
 
407 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  47.1 
 
 
409 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  47.69 
 
 
405 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  49.14 
 
 
409 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  49.26 
 
 
406 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  47.97 
 
 
404 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  49.02 
 
 
405 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  47.58 
 
 
406 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  47.36 
 
 
407 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  49.26 
 
 
412 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  49.51 
 
 
399 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  47.34 
 
 
406 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  47.23 
 
 
405 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  48.15 
 
 
408 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  49.02 
 
 
406 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  47.17 
 
 
405 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  46.34 
 
 
402 aa  378  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  48.41 
 
 
403 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  47.45 
 
 
406 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  47.88 
 
 
409 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  46.68 
 
 
405 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  45.56 
 
 
407 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  47.16 
 
 
409 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  47.22 
 
 
401 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4163  argininosuccinate synthase  48.42 
 
 
404 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  46.81 
 
 
408 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  47.2 
 
 
406 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  48.11 
 
 
410 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  47.79 
 
 
409 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  47.14 
 
 
406 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  47.3 
 
 
404 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  47.42 
 
 
410 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  48.42 
 
 
402 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  48.18 
 
 
408 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  45.08 
 
 
402 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  47.46 
 
 
403 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  46.14 
 
 
412 aa  373  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  47.84 
 
 
413 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  47.52 
 
 
396 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  46.57 
 
 
408 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  47.39 
 
 
409 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  47.23 
 
 
405 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  46.62 
 
 
406 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  45.93 
 
 
406 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  46.37 
 
 
413 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  46.63 
 
 
412 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  48.32 
 
 
413 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  46.14 
 
 
413 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  47.94 
 
 
404 aa  370  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  46.94 
 
 
407 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  46.34 
 
 
408 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  46.91 
 
 
1496 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  45.89 
 
 
412 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  46.14 
 
 
413 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  45.26 
 
 
410 aa  368  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  48.16 
 
 
409 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  45.39 
 
 
401 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  46.68 
 
 
409 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>