More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_18693 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  100 
 
 
1351 aa  2760    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  33.21 
 
 
1317 aa  617  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  32.48 
 
 
1535 aa  558  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  32.26 
 
 
1549 aa  558  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  30.95 
 
 
1168 aa  531  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  30.94 
 
 
1135 aa  526  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  31.59 
 
 
1157 aa  498  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  29.9 
 
 
1640 aa  497  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  30.33 
 
 
1636 aa  496  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  29.08 
 
 
1549 aa  475  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  29.88 
 
 
1573 aa  475  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  27.82 
 
 
1248 aa  445  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  26.27 
 
 
1458 aa  434  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  27.99 
 
 
1423 aa  431  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  29.39 
 
 
1127 aa  426  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.26 
 
 
1705 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  27.85 
 
 
1463 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  39.47 
 
 
1667 aa  349  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  32.81 
 
 
1256 aa  343  1e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  32.54 
 
 
1623 aa  317  9.999999999999999e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.23 
 
 
1396 aa  308  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  35.26 
 
 
1367 aa  307  8.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  31.96 
 
 
1513 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  34.19 
 
 
1514 aa  277  8e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  32.21 
 
 
1381 aa  277  8e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.75 
 
 
1456 aa  272  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  31.62 
 
 
1416 aa  267  8.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  33.59 
 
 
1587 aa  266  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.02 
 
 
1659 aa  262  4e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  33.84 
 
 
1557 aa  251  6e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185378 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.01 
 
 
1669 aa  247  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  30.08 
 
 
1507 aa  245  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  30.5 
 
 
1607 aa  229  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  31.54 
 
 
1115 aa  220  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  29.65 
 
 
1511 aa  207  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  29.26 
 
 
1562 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  30.26 
 
 
1773 aa  202  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  28.11 
 
 
727 aa  197  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.52 
 
 
597 aa  191  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  29.98 
 
 
592 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  30.64 
 
 
590 aa  188  6e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  28.6 
 
 
610 aa  188  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  29.96 
 
 
590 aa  185  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.41 
 
 
739 aa  181  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  29.11 
 
 
596 aa  181  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  29.55 
 
 
590 aa  181  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  30.63 
 
 
595 aa  180  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  27.64 
 
 
741 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  30.5 
 
 
596 aa  179  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  29.4 
 
 
1611 aa  177  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.22 
 
 
581 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.69 
 
 
1003 aa  175  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  28.97 
 
 
637 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.96 
 
 
579 aa  175  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.27 
 
 
589 aa  175  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.21 
 
 
628 aa  175  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  28.68 
 
 
593 aa  174  6.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.21 
 
 
625 aa  175  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  27.29 
 
 
590 aa  174  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  29.39 
 
 
609 aa  174  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  29.62 
 
 
598 aa  174  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  30.43 
 
 
596 aa  172  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  29.96 
 
 
652 aa  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  29.35 
 
 
625 aa  172  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  27.79 
 
 
582 aa  172  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  30.06 
 
 
980 aa  171  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  31.57 
 
 
661 aa  172  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.61 
 
 
627 aa  171  7e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  27.15 
 
 
619 aa  171  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0921  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.17 
 
 
579 aa  171  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.451099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  29.87 
 
 
641 aa  171  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.08 
 
 
597 aa  171  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  28.98 
 
 
666 aa  170  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  31.56 
 
 
577 aa  170  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  28.68 
 
 
669 aa  170  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.4 
 
 
589 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  28.05 
 
 
586 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  30.08 
 
 
614 aa  169  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  29.48 
 
 
738 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  29.5 
 
 
624 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  28.99 
 
 
577 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  29.76 
 
 
594 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.14 
 
 
666 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.14 
 
 
666 aa  169  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  26.84 
 
 
617 aa  169  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.37 
 
 
971 aa  169  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  30.51 
 
 
677 aa  169  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.22 
 
 
582 aa  169  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.8 
 
 
1000 aa  168  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.1 
 
 
727 aa  168  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  27.05 
 
 
671 aa  168  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  29.01 
 
 
640 aa  168  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  30.57 
 
 
633 aa  168  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  29.24 
 
 
603 aa  168  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  29.71 
 
 
603 aa  168  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  28.97 
 
 
600 aa  168  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  31.08 
 
 
634 aa  168  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  29.06 
 
 
615 aa  167  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.79 
 
 
1024 aa  167  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.67 
 
 
584 aa  167  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>