50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_18549 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_18549  predicted protein  100 
 
 		 1250 aa  2610    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74320  Kontroller Of Growth  29.22 
 
 		 1399 aa  539  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.264434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41144  predicted protein  41.5 
 
 		 1295 aa  508  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.16252  normal  0.0548409 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04639  TORC1 growth control complex subunit Kog1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02510)  37.7 
 
 		 1431 aa  462  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01940  conserved hypothetical protein  38.52 
 
 		 1507 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45807  predicted protein  89.01 
 
 		 173 aa  169  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.484224  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03060  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1250 aa  63.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.09 
 
 		 1901 aa  59.7  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.56 
 
 		 682 aa  57.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.56 
 
 		 1163 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.84 
 
 		 677 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.91 
 
 		 1474 aa  53.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00230  U5 snRNP-specific 40 kDa protein, putative  21.9 
 
 		 374 aa  53.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.718611  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.81 
 
 		 1411 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56432  predicted protein  26.92 
 
 		 407 aa  52.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491701  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1190 aa  51.6  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.63 
 
 		 1557 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.32 
 
 		 1652 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  22.86 
 
 		 359 aa  50.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1196 aa  50.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  22.87 
 
 		 1193 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.96 
 
 		 1236 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.25 
 
 		 692 aa  49.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  21.2 
 
 		 1484 aa  48.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  20.74 
 
 		 1831 aa  48.5  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.14 
 
 		 576 aa  48.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.27 
 
 		 1262 aa  48.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  22.36 
 
 		 1188 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53071  predicted protein  26.47 
 
 		 935 aa  47.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08183  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (Pwp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03090)  26.54 
 
 		 851 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559435  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 		 1711 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  23.58 
 
 		 696 aa  47  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.42 
 
 		 1868 aa  46.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  26.79 
 
 		 589 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 1221 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  22.55 
 
 		 1443 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.85 
 
 		 1213 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  27.93 
 
 		 324 aa  46.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 		 1363 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  25 
 
 		 1330 aa  45.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  20.33 
 
 		 1247 aa  45.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  22.48 
 
 		 505 aa  45.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.29 
 
 		 676 aa  45.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  21.54 
 
 		 612 aa  45.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1643  WD-40 repeat protein  23.46 
 
 		 520 aa  45.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1670  WD-40 repeat protein  23.46 
 
 		 520 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.27 
 
 		 698 aa  45.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 443 aa  45.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  19.73 
 
 		 464 aa  44.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  22.03 
 
 		 687 aa  44.7  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>