More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_18475 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  69.72 
 
 
468 aa  665    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  99.77 
 
 
439 aa  900    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  72.16 
 
 
459 aa  680    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  100 
 
 
439 aa  902    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  73.93 
 
 
458 aa  688    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  73.93 
 
 
458 aa  688    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  53.56 
 
 
433 aa  488  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  53.05 
 
 
425 aa  486  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  53.74 
 
 
425 aa  484  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  53.26 
 
 
432 aa  476  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  53.35 
 
 
425 aa  476  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  53.77 
 
 
424 aa  476  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  52.1 
 
 
426 aa  477  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  53.12 
 
 
425 aa  472  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  51.54 
 
 
435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  51.77 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  51.95 
 
 
428 aa  461  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  52.4 
 
 
428 aa  464  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  51.72 
 
 
428 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  51.63 
 
 
424 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  51.95 
 
 
428 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  52.64 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  51.4 
 
 
422 aa  456  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  50.12 
 
 
423 aa  449  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  50.96 
 
 
420 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  50.72 
 
 
420 aa  442  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  51.07 
 
 
421 aa  442  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  50 
 
 
423 aa  443  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  50.12 
 
 
444 aa  442  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  50.35 
 
 
422 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  50.96 
 
 
420 aa  440  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  49.41 
 
 
444 aa  436  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  49.65 
 
 
444 aa  437  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  48.7 
 
 
444 aa  434  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  49.41 
 
 
444 aa  434  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  41.09 
 
 
467 aa  338  9e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  41.09 
 
 
467 aa  338  9e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  41.09 
 
 
467 aa  338  9e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  40 
 
 
707 aa  328  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  37.76 
 
 
757 aa  303  5.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  40.51 
 
 
576 aa  297  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  36.67 
 
 
708 aa  294  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  37.93 
 
 
914 aa  291  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  37.09 
 
 
406 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  34.84 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.72 
 
 
564 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  34.24 
 
 
481 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  34.92 
 
 
581 aa  238  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.47 
 
 
639 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  32.94 
 
 
516 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.81 
 
 
639 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  33.41 
 
 
636 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.33 
 
 
642 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.49 
 
 
641 aa  219  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  33.25 
 
 
641 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.81 
 
 
645 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  33.49 
 
 
642 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  39.39 
 
 
601 aa  212  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.11 
 
 
599 aa  210  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.76 
 
 
636 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.48 
 
 
615 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3126  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  36.36 
 
 
626 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.07 
 
 
614 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  30.07 
 
 
604 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.92 
 
 
598 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2352  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.75 
 
 
551 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.924472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.35 
 
 
599 aa  194  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0635  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.84 
 
 
428 aa  193  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217595  normal  0.169289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  34.72 
 
 
408 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1865  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.8 
 
 
551 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.57 
 
 
633 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1004  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.47 
 
 
422 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0829  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.6 
 
 
543 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15121  predicted protein  28.79 
 
 
450 aa  190  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00103501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1491  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.05 
 
 
412 aa  190  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.88 
 
 
644 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.34 
 
 
640 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.38 
 
 
470 aa  187  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0819  sulfate adenylyltransferase subunit 1  29.03 
 
 
481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1674  sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.44 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.313363  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2735  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.81 
 
 
552 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4560  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.7 
 
 
633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6191  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.93 
 
 
633 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.19 
 
 
651 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0420  sulfate adenylyltransferase subunit 1  30.84 
 
 
422 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3125  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.52 
 
 
450 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2724  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.52 
 
 
450 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000102615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3978  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.68 
 
 
422 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2183  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.52 
 
 
537 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3342  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.77 
 
 
640 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.914743  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0738  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.92 
 
 
435 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20107  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1018  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  28 
 
 
634 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.19 
 
 
559 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1687  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  32.01 
 
 
638 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2552  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.01 
 
 
474 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2429  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.4 
 
 
462 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.31 
 
 
647 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2476  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.49 
 
 
438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1860  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.49 
 
 
438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2471  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.49 
 
 
438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>