More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_18473 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  100 
 
 
645 aa  1319    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  40.72 
 
 
581 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
598 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.62 
 
 
601 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  38.06 
 
 
586 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
623 aa  364  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  37.94 
 
 
586 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  36.71 
 
 
598 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  40.27 
 
 
603 aa  355  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07730  multidrug resistance protein 1, putative  39.7 
 
 
1408 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.02 
 
 
628 aa  348  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  37.5 
 
 
600 aa  347  3e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  37.73 
 
 
598 aa  347  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  35.92 
 
 
596 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.27 
 
 
782 aa  344  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.33 
 
 
601 aa  344  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  38.61 
 
 
594 aa  342  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  40.68 
 
 
597 aa  342  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20026  predicted protein  37.74 
 
 
646 aa  341  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.34 
 
 
641 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.96 
 
 
627 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  33.54 
 
 
614 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  36.53 
 
 
597 aa  337  5e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.4 
 
 
639 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
601 aa  336  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.58 
 
 
634 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 
619 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.16 
 
 
632 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.09 
 
 
597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.04 
 
 
600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.04 
 
 
600 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
586 aa  327  6e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.29 
 
 
600 aa  325  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.31 
 
 
586 aa  323  5e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1202  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.54 
 
 
608 aa  323  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.45 
 
 
590 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.99 
 
 
580 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.43 
 
 
608 aa  320  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  38.96 
 
 
599 aa  319  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  35.16 
 
 
1343 aa  318  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.71 
 
 
619 aa  317  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.27 
 
 
597 aa  317  6e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  36.42 
 
 
589 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  38.58 
 
 
681 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.38 
 
 
616 aa  315  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.89 
 
 
593 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.19 
 
 
589 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.77 
 
 
605 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  36.05 
 
 
606 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  35.88 
 
 
601 aa  313  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.6 
 
 
614 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.92 
 
 
616 aa  313  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.29 
 
 
586 aa  312  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.11 
 
 
629 aa  310  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.77 
 
 
606 aa  310  5e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.84 
 
 
650 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  34.76 
 
 
594 aa  310  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  33.45 
 
 
588 aa  309  9e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.91 
 
 
595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.35 
 
 
582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  31.55 
 
 
1284 aa  306  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.76 
 
 
600 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.94 
 
 
589 aa  306  6e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.84 
 
 
603 aa  306  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.38 
 
 
601 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.8 
 
 
589 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  31.36 
 
 
602 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.66 
 
 
597 aa  303  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  32.45 
 
 
583 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.88 
 
 
605 aa  303  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.59 
 
 
622 aa  303  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  35.8 
 
 
582 aa  302  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  33.54 
 
 
764 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  31.4 
 
 
573 aa  301  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.09 
 
 
608 aa  301  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0681  ABC transporter related  34.35 
 
 
575 aa  301  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  34.35 
 
 
575 aa  301  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.43 
 
 
605 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.75 
 
 
597 aa  301  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  34.69 
 
 
611 aa  300  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.16 
 
 
597 aa  300  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.86 
 
 
590 aa  300  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76772  ATP-binding cassette transporter family member  34.17 
 
 
575 aa  299  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304707  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2119  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.05 
 
 
587 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  36.22 
 
 
594 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.4 
 
 
617 aa  299  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.72 
 
 
606 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.2 
 
 
618 aa  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.09 
 
 
618 aa  298  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.08 
 
 
575 aa  297  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01820  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.77 
 
 
725 aa  297  4e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  32.52 
 
 
575 aa  297  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1636  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.86 
 
 
568 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663719  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.3 
 
 
625 aa  297  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  34.92 
 
 
616 aa  296  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3622  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.48 
 
 
587 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  33.66 
 
 
578 aa  296  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  33.66 
 
 
578 aa  296  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.99 
 
 
637 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  33.38 
 
 
750 aa  295  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>