106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_1389 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  100 
 
 
334 aa  652    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  32.61 
 
 
899 aa  155  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  35.11 
 
 
350 aa  149  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  33.33 
 
 
2491 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  31.72 
 
 
526 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  29.58 
 
 
601 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  32.92 
 
 
1012 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  31 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  28.57 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  29.11 
 
 
1017 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39117  predicted protein  33.33 
 
 
587 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294419  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  26.17 
 
 
716 aa  106  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  31.14 
 
 
247 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  35.41 
 
 
685 aa  103  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  34.04 
 
 
508 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  28.5 
 
 
447 aa  96.3  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  30.71 
 
 
304 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.93 
 
 
482 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  26.49 
 
 
640 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  27.11 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  28.31 
 
 
249 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  35.05 
 
 
416 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  32.41 
 
 
230 aa  86.3  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.97 
 
 
1107 aa  85.9  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.05 
 
 
867 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  29.28 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  30.35 
 
 
1041 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.75 
 
 
1263 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.83 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  28.17 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.23 
 
 
937 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  29.09 
 
 
4500 aa  75.5  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.91 
 
 
937 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  35.37 
 
 
169 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  29.91 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  35.81 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43724  predicted protein  28.49 
 
 
890 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49671  predicted protein  28.4 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.245553  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  28.99 
 
 
633 aa  66.6  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33901  predicted protein  23.91 
 
 
596 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  24.36 
 
 
2324 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  29.33 
 
 
892 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  33.75 
 
 
543 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_6311  predicted protein  31.58 
 
 
127 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  30.59 
 
 
1000 aa  60.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.14 
 
 
757 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  24.05 
 
 
648 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  32.85 
 
 
237 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49666  predicted protein  23.22 
 
 
540 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.61 
 
 
713 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11423  predicted protein  37.5 
 
 
168 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
440 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  28.57 
 
 
682 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31.72 
 
 
1015 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  28.43 
 
 
497 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 
445 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15749  predicted protein  41.1 
 
 
81 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00765977  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49769  predicted protein  26.39 
 
 
593 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18438  predicted protein  25.94 
 
 
512 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  31.88 
 
 
1744 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 
436 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  37.33 
 
 
768 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.89 
 
 
476 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  26.45 
 
 
863 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  25 
 
 
1749 aa  53.1  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  28.8 
 
 
307 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30.85 
 
 
886 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  28.72 
 
 
434 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 
469 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  24.31 
 
 
2132 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.18 
 
 
1024 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  31.14 
 
 
446 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 
447 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
451 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 
441 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  30.81 
 
 
451 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
471 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 
450 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  30.81 
 
 
451 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46793  predicted protein  36.99 
 
 
329 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.77 
 
 
472 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  32.56 
 
 
446 aa  46.2  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  23.84 
 
 
1344 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  28.74 
 
 
451 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  29.68 
 
 
490 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
437 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
447 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
437 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  30.95 
 
 
447 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 
460 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.16 
 
 
448 aa  44.3  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  31.87 
 
 
467 aa  44.3  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38108  predicted protein  40.68 
 
 
461 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 
441 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  31.85 
 
 
1290 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 
432 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 
437 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  28.2 
 
 
765 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
459 aa  43.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>