More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13537 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13537  predicted protein  100 
 
 		 290 aa  601  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175423  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11003  predicted protein  58.98 
 
 		 296 aa  354  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  44.48 
 
 		 369 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  41.79 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  42.91 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  42.55 
 
 		 371 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  41.58 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  40.14 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  37.87 
 
 		 409 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  42.5 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  38.05 
 
 		 403 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  37.87 
 
 		 413 aa  178  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1782  radical SAM protein  38.38 
 
 		 349 aa  178  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  40.57 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.85 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  41.3 
 
 		 383 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  40.74 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.21 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  40.14 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.78 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  41.3 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.73 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.21 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.21 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.51 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.93 
 
 		 358 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1429  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.76 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0876618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  40.21 
 
 		 379 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.18 
 
 		 373 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.05 
 
 		 373 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  40.21 
 
 		 378 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1165  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.21 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665651  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  40.35 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  41.05 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.9 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.18 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.18 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.34 
 
 		 373 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.83 
 
 		 373 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.83 
 
 		 373 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.7 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.41 
 
 		 371 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  40.79 
 
 		 370 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  41.2 
 
 		 376 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  40.79 
 
 		 370 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  41.4 
 
 		 381 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  41.05 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  41.05 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0663  radical SAM enzyme, Cfr family  40.4 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0103846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  41.05 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  40.74 
 
 		 382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1198  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.14 
 
 		 365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.347563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  39.86 
 
 		 362 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1574  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.11 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  38.89 
 
 		 382 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.08 
 
 		 372 aa  172  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  41.61 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  41.26 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  40.62 
 
 		 378 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  40.62 
 
 		 378 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  40.62 
 
 		 378 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1347  radical SAM protein  40.62 
 
 		 378 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1422  radical SAM protein  40.54 
 
 		 382 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12366  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  40.62 
 
 		 378 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  38.87 
 
 		 382 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  40.62 
 
 		 378 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.38 
 
 		 356 aa  171  9e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  40.62 
 
 		 378 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4255  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.64 
 
 		 386 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  38.94 
 
 		 393 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  38.3 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  41.26 
 
 		 383 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  39.86 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  40.89 
 
 		 394 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.38 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  40.62 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.14 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  37.88 
 
 		 404 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  40.62 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  39.72 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  40 
 
 		 367 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  38.68 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  40.62 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  38.65 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.64 
 
 		 351 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1461  radical SAM protein  40.62 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0453987  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  38.94 
 
 		 382 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  37.76 
 
 		 391 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  40.36 
 
 		 392 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  39.86 
 
 		 397 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  40.14 
 
 		 384 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.97 
 
 		 359 aa  169  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  40.49 
 
 		 384 aa  168  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  36.79 
 
 		 406 aa  168  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  38.3 
 
 		 382 aa  168  9e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  40.21 
 
 		 381 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  39.22 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  39.06 
 
 		 340 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  37.8 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>